聚合数据帧 R 的 2 列

Question

我的dataframe如下

TreeID    Species    PlotNo    Basalarea
12345       A          1         120
13242       B          7         310
14567       D          8         250
13245       B          1         305
13426       B          1         307
13289       A          3         118

我用过

newdata<- aggregate(Basalarea~PlotNo+Species, data, sum, na.rm=TRUE)

聚合所有值，使得

 newdata
     Species    PlotNo    Basalarea
       A          1         120
       A          3         118
       B          1         some value
       B          7         310
       D          8         250

这很好，但我想要一个这样的数据框

PlotNo    A       B            D
 1        120    some value    0
 3        118    0             0
 7        0      310           0
 8        0      0            250

如何获取上述数据框？

Answer 1

我们可以使用dcast将长格式转换为宽格式。将 fun.aggregate 指定为 sum.

library(reshape2)
dcast(df1, PlotNo~Species, value.var='Basalarea', sum)
#  PlotNo   A   B   D
#1      1 120 612   0
#2      3 118   0   0
#3      7   0 310   0
#4      8   0   0 250

或者 base R 选项将使用 xtabs。默认情况下，对于 'PlotNo' 和 'Species'.

的组合，它获取 'Basalarea' 的 sum

xtabs(Basalarea~PlotNo+Species, df1)
#     Species
#PlotNo   A   B   D
#     1 120 612   0
#     3 118   0   0
#     7   0 310   0
#     8   0   0 250

或者另一个base R选项是tapply

with(df1, tapply(Basalarea, list(PlotNo, Species), FUN=sum))

聚合数据帧 R 的 2 列

Aggregating over 2 columns of a dataframe R

r

aggregate-functions