pdist 和 pdist2 的不同行为

Question

在 MATLAB 代码中，我使用 kullback_leibler_divergence 相异函数，可以找到 here。

我有一个矩阵 A，我使用下载的函数计算差异矩阵。

理论上，如果我计算

clear
A = rand(132,6); % input matrix
diss_mat = pdist(A,'@kullback_leibler_divergence'); % calculate the dissimilarity
square_diss_mat = squareform(diss_mat); % I put the dissimilarities in a square matrix
one_dist = pdist2(A(1,:),A,@kullback_leibler_divergence);

我应该让 square_diss_mat 的第一行等于 one_dist，但我没有。

如果我使用欧几里得距离，我会得到它：

diss_mat = pdist(A);
square_diss_mat = squareform(diss_mat);
one_dist = pdist2(A(1,:),A);

你能告诉我为什么吗？

Answer 1

kullback_leibler_divergence 不是对称的，因此顺序很重要：

one_dist = pdist2(A, A(1,:), @kullback_leibler_divergence);

我没有看到任何使用具有 pdist 或 pdist2 的非对称函数的实际应用。

pdist 和 pdist2 的不同行为

Different behaviour for pdist and pdist2

matlab

distance

pdist