如何从 HDF5 文件制作 RasterBrick？ R

Question

如何从多个 hdf5 文件中制作 Rasterbrick in R？通常，数据以 hdf5 格式提供，必须将其转换为更友好的格式以便于处理。

目前我知道 rhdf5 package 但我不确定如何获得 RasterBrick。

source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("rhdf5")
library("rhdf5")
library("raster")

您可以在此 link http://mirador.gsfc.nasa.gov/cgi-bin/mirador/cart.pl?C1=GPM_3IMERGHH&CGISESSID=fb3b45e091f081aba8823f3e3f85a7d9&LBT_THRESHOLD=4000000.

上访问多个 hdf5 文件

你可以用两个文件来说明。

谢谢！

AT.

Answer 1

一个选项是使用 gdalUtils 将 hdf5 文件转换为 GTiff。一旦你这样做了，你就可以在一个堆栈中阅读它们。这是一个示例代码：

# list all the `hdf5` files 
files <- list.files(path=".", pattern=paste(".*.h5",sep=""), all.files=FALSE, full.names=TRUE)
#choose the band that you want using the sds[] option and write GTiff files.
  for (i in (files)) {
  sds <- get_subdatasets(i)
  r2 <- gdal_translate(sds[1], dst_dataset =paste(i,".tif",sep=""))}

如何从 HDF5 文件制作 RasterBrick？ R

How to Make a RasterBrick from HDF5 Files? R

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