如何将色谱图显示为图像？

Question

我正在 Netbeans 上使用 1.8.1 版本的 biojava，并使用 ChromatogramGraphic Class 来尝试创建色谱图的图像。 (http://www.biojava.org/docs/api1.8/)

我制作了一个文件选择器来访问色谱图，我使用 ChromatogramFactory（来自 biojava）Class 从文件中创建一个色谱图对象。

显然，这：

http://biojava.org/pipermail/biojava-l/2003-June/003896.html

代码可以完成我想要的。我不明白它的作用，我不认为我可以使用类似的语法在我的 JFrame 上绘制图像。

如有任何帮助，我们将不胜感激。

[到目前为止我有什么。我不知道其中大部分是做什么的。]

    private void renderTrace() throws IOException, UnsupportedChromatogramFormatException {
    ABIFChromatogram abiChrom = new ABIFChromatogram();

    File abi = new File(textarea.getText());

    ABITrace abiTrace = new ABITrace(abi);
    ABIFParser abiParse = new ABIFParser(abi);
    ChromatogramFactory chromFactory = new ChromatogramFactory();


    Chromatogram chrom = ChromatogramFactory.create(abi);


    ChromatogramGraphic gfx = new ChromatogramGraphic(chrom);

    gfx.setHeight(240);
    gfx.setHorizontalScale(2.0f);
     // set some options that affect the output
    // turn off filled-in "callboxes"
    gfx.setOption(ChromatogramGraphic.Option.DRAW_CALL_A,
            Boolean.FALSE);
    gfx.setOption(ChromatogramGraphic.Option.DRAW_CALL_C,
            Boolean.FALSE);
    gfx.setOption(ChromatogramGraphic.Option.DRAW_CALL_G,
            Boolean.FALSE);
    gfx.setOption(ChromatogramGraphic.Option.DRAW_CALL_T,
            Boolean.FALSE);
    gfx.setOption(ChromatogramGraphic.Option.DRAW_CALL_OTHER,
            Boolean.FALSE);
     // this option controls whether each trace/callbox/etc is scaled/positioned
    // individually, or whether the scaling is done on all shapes at the level
    // of the graphics context
    // enabling this option is recommended for higher-quality output

    gfx.setOption(ChromatogramGraphic.Option.USE_PER_SHAPE_TRANSFORM,
            Boolean.TRUE);

    BufferedImage bi = new BufferedImage(
                               gfx.getWidth(), 
                               gfx.getHeight(), 
                               BufferedImage.TYPE_INT_RGB);
    Graphics2D g2 = bi.createGraphics();
    g2.setBackground(Color.white);
    g2.clearRect(0, 0, bi.getWidth(), bi.getHeight());
    if (g2.getClip() == null) {
        g2.setClip(new Rectangle(0, 0, bi.getWidth(), bi.getHeight()));
    }
    g2.setRenderingHint(RenderingHints.KEY_ANTIALIASING, RenderingHints.VALUE_ANTIALIAS_ON);
    // the main event
    gfx.drawTo(g2);
    // work-around an OS X bug where sometimes the last Shape drawn
    // doesn't show up in the output
    g2.draw(new java.awt.Rectangle(-10, -10, 5, 5));


    gfx.drawTo();


}

Answer 1

如果可行，那么您可以使用 JFrame 的 paint() 方法绘制图像。首先你需要确保这个

gfx.drawTo(g2);

有效，从 gfx 方面。尝试将图像保存到文件中，看看是否存在

try {
  ImageIO.write(bi, "png", new File("gfx-image.png"));
} catch (IOException ex) { ex.printStackTrace(); }

导入 javax.imageio.*;在您的导入语句中。

如果可行并且您可以看到图像，那么在 JFrame 中您需要有类似

的东西

public void paint(Graphics g) {
  g.drawImage(bi, 0, 0, this);
}

如何将色谱图显示为图像？

How can I display a chromatogram as an image?

java

swing

image

jframe

biojava