Spark、DataFrame：对组应用 transformer/estimator

Question

我有一个如下所示的 DataFrame：

+-----------+-----+------------+
|     userID|group|    features|
+-----------+-----+------------+
|12462563356|    1|  [5.0,43.0]|
|12462563701|    2|   [1.0,8.0]|
|12462563701|    1|  [2.0,12.0]|
|12462564356|    1|   [1.0,1.0]|
|12462565487|    3|   [2.0,3.0]|
|12462565698|    2|   [1.0,1.0]|
|12462565698|    1|   [1.0,1.0]|
|12462566081|    2|   [1.0,2.0]|
|12462566081|    1|  [1.0,15.0]|
|12462566225|    2|   [1.0,1.0]|
|12462566225|    1|  [9.0,85.0]|
|12462566526|    2|   [1.0,1.0]|
|12462566526|    1|  [3.0,79.0]|
|12462567006|    2| [11.0,15.0]|
|12462567006|    1| [10.0,15.0]|
|12462567006|    3| [10.0,15.0]|
|12462586595|    2|  [2.0,42.0]|
|12462586595|    3|  [2.0,16.0]|
|12462589343|    3|   [1.0,1.0]|
+-----------+-----+------------+

其中列类型为：userID：Long，group：Int，以及 features:vector。

这已经是一个分组的DataFrame，即一个用户ID最多会出现在一个特定的组中。

我的目标是缩放每个组的 features 列。

有没有办法对每个组应用feature transformer (in my case I would like to apply a StandardScaler) 而不是将其应用到完整的DataFrame。

P.S。使用 ML 不是强制性的，因此如果解决方案基于 MLlib，则没有问题。

Answer 1

计算统计数据

Spark >= 3.0

现在 Summarizer 支持标准偏差，因此

val summary = data
  .groupBy($"group")
  .agg(Summarizer.metrics("mean", "std")
  .summary($"features").alias("stats"))
  .as[(Int, (Vector, Vector))]
  .collect.toMap

Spark >= 2.3

在 Spark 2.3 或更高版本中，您还可以使用 Summarizer:

import org.apache.spark.ml.stat.Summarizer

val summaryVar = data
  .groupBy($"group")
  .agg(Summarizer.metrics("mean", "variance")
  .summary($"features").alias("stats"))
  .as[(Int, (Vector, Vector))]
  .collect.toMap

并调整下游代码以处理差异而不是标准偏差。

Spark < 2.0，Spark < 2.3，并针对 .

之间的转换进行了调整

您可以使用与默认代码几乎相同的代码按组计算统计信息Scaler:

import org.apache.spark.mllib.stat.MultivariateOnlineSummarizer
import org.apache.spark.mllib.linalg.{Vector, Vectors}
import org.apache.spark.sql.Row

// Compute Multivariate Statistics 
val summary = data.select($"group", $"features")
    .rdd
    .map {
         case Row(group: Int, features: Vector) => (group, features) 
    }
    .aggregateByKey(new MultivariateOnlineSummarizer)(/* Create an empty new MultivariateOnlineSummarizer */
         (agg, v) => agg.add(v), /* seqOp : Add a new sample Vector to this summarizer, and update the statistical summary. */
         (agg1, agg2) => agg1.merge(agg2)) /* combOp : As MultivariateOnlineSummarizer accepts a merge action with another MultivariateOnlineSummarizer, and update the statistical summary. */
    .mapValues {
      s => (
         s.variance.toArray.map(math.sqrt(_)), /* compute the square root variance for each key */
         s.mean.toArray /* fetch the mean for each key */
      )
    }.collectAsMap

转型

如果预期的组数相对较少，您可以广播这些：

val summaryBd = sc.broadcast(summary)

并转换您的数据：

val scaledRows = df.rdd.map{ case Row(userID, group: Int, features: Vector) =>
  val (stdev, mean)  =  summaryBd.value(group)
  val vs = features.toArray.clone()
  for (i <- 0 until vs.size) {
    vs(i) = if(stdev(i) == 0.0) 0.0 else (vs(i) - mean(i)) * (1 / stdev(i))
  }
  Row(userID, group, Vectors.dense(vs))
}
val scaledDf = sqlContext.createDataFrame(scaledRows, df.schema)

否则你可以直接加入。将其包装为以组列为参数的 ML 转换器应该不难。

Spark、DataFrame：对组应用 transformer/estimator

Spark, DataFrame: apply transformer/estimator on groups

apache-spark

spark-dataframe

apache-spark-mllib

apache-spark-ml

计算统计数据

Spark >= 3.0

Spark >= 2.3

Spark < 2.0，Spark < 2.3，并针对 .

转型