通过numpy.genfromtxt python读取数据时不要让'nan'为'0'

Question

现在我正在尝试读取名为 "filin1" 的文件中的数组，例如：

filin1 = [1,3,4, ....,nan,nan,nan..] (in the file, actually it is just a column not an array like this)

所以，我正在尝试将 numpy.genfromtxt 用作：

 np.genfromtxt(filin1,dtype=None,delimiter=',',usecols=[0],missing_values='Missing',usemask=False,filling_values=np.nan)

我希望得到 [1,3,4, ....,nan,nan,nan..]，但结果是：

[1,3,4, ....,0.,0.,0...]

我想保留 'nan' 而不将其转换为“0”。

请问您有什么想法或建议吗？

谢谢，艾萨克

Answer 1

如果我尝试用字符串输入来模拟你的情况，我可以毫无问题地阅读 nan

In [73]: txt=b'''1,2
3,4
1.23,nan
nan,02
'''
In [74]: txt=txt.splitlines()
In [75]: txt
Out[75]: [b'1,2', b'3,4', b'1.23,nan', b'nan,02']
In [76]: np.genfromtxt(txt,delimiter=',')
Out[76]: 
array([[ 1.  ,  2.  ],
       [ 3.  ,  4.  ],
       [ 1.23,   nan],
       [  nan,  2.  ]])

nan 是一个有效的浮点值

In [80]: float('nan')
Out[80]: nan

你的命令也有效，尽管它有效

In [82]: np.genfromtxt(txt,dtype=None,delimiter=',',usecols=[0],missing_values='Missing',usemask=False,filling_values=np.nan)
Out[82]: array([ 1.  ,  3.  ,  1.23,   nan])

期望列包含整数（而不是浮点数）可能会导致问题，因为 nan 是浮点数，而不是整数。

缺失值导致两次调用 nan

In [91]: txt
Out[91]: [b'1,2', b'3,', b'1.23,nan', b'nan,02', b',']

通过numpy.genfromtxt python读取数据时不要让'nan'为'0'

Not to make 'nan' to '0' when reading the data through numpy.genfromtxt python

numpy

nan

genfromtxt