如何使用 h5py 从 HDF5 数据集中读取字符串

Question

我有一个HDF5文件h5dump如下（省略无关内容）

HDF5 "file.h5" {
GROUP "/" {
  DATASET "history" {
    DATATYPE  H5T_STRING {
      STRSIZE H5T_VARIABLE;
      STRPAD H5T_STR_NULLTERM;
      CSET H5T_CSET_ASCII;
      CTYPE H5T_C_S1;
    }
    DATASPACE  SIMPLE { ( 1 ) / ( H5S_UNLIMITED ) }
    DATA {
    (0): "some string"
    }
  }
}

我正在尝试使用 h5py 从 python (3.5) 中读取。我目前的尝试是

import h5py
F = h5py.File('file.h5', "r")
H = list()
for x in F['history']:
    H.append(str(x))

但是

for x in H:
    print(x)

生产

b'some string'

而不是简单地

some string

如何提取纯数据字符串？我需要做什么而不是 str(x)?

P.S。这是我的第一个python问题，请多多包涵。

Answer 1

只需使用

H = [x.decode() for x in F['history']]

此列表理解将 return H 作为字符串列表。

如何使用 h5py 从 HDF5 数据集中读取字符串

How to read strings from HDF5 dataset using h5py

python

hdf5

python-3.x

h5py