示例 OpenMRS MySQL 查询以从数据库中读取数据

Question

我在肯尼亚基苏木的一家医院本地实施了 1.9.7 版 openmrs。由于 OpenMrs 数据库的复杂性，当我尝试编写查询以访问从数据库收集的患者数据以进行数据管理时，问题就来了。我也对 sql 有点厌倦，因为我已经有一段时间没有练习了，但我需要尽快拿出数据。我目前的查询如下

  SELECT p.date_created as date_enrolled, pi.identifier,     pi.identifier_type     identifier_type ,
 pn.given_name,pn.middle_name, pn.family_name, p.person_id, p.gender, p.birthdate, p.death_date,  
ob.obs_datetime, cm.name as obs_type, CASE co.datatype_id    when '1' then ob.value_numeric   
when '2' then  (select name from concept_name where concept_id = ob.value_coded limit 1)   
 when '3' then ob.value_text    when '6' then ob.value_datetime    when '10' then ob.value_boolean    when '13' then ob.value_complex else "N/A" END AS obs_value, e.encounter_datetime 
FROM person p JOIN person_name pn ON p.person_id = pn.person_id
JOIN patient_identifier pi ON p.person_id = pi.patient_id 
JOIN patient_identifier_type pit ON pit.patient_identifier_type_id = pi.identifier_type 
JOIN obs ob ON p.person_id = ob.person_id JOIN encounter e ON e.encounter_id = ob.encounter_id 
JOIN concept_name cm ON ob.concept_id = cm.concept_id
JOIN concept co ON ob.concept_id = co.concept_id
JOIN concept_datatype cdt ON cdt.concept_datatype_id = co.datatype_id;

是否已使用现有的查询，我可以将其用作启动器并可能修改以满足我的需要？或者更确切地说，您建议我如何最好地完成这个过程？

谢谢

Answer 1

考虑到所涉及的所有 table，你做得很好。这非常复杂 SQL，因为您将 header 和详细数据混合在一行中。如果您想在单个查询中写一些东西，那么这里有 2 个相当大的问题：1) concept_name 有多个语言环境（语言），而我怀疑您只想要一个。尝试像 locale='en' 这样的东西来减少行数。 2) obs table 是EAV (entity-attribute-value)，加上你发现，不同的值字段对应不同的数据类型。要解决这个问题，请查看 MySql 的 GROUP_CONCAT 函数。这是进行查询的粗略镜头，尽管我删除了一些内容以简化并使其正常工作。它会让您了解如何使用 GROUP_CONCAT，但我强调了数据类型 -> value CASE 语句：

SELECT p.date_created as date_enrolled, 
pi.identifier, pi.identifier_type, pn.given_name,  
left(GROUP_CONCAT(ob.obs_datetime, cm.name SEPARATOR '\t'),60) as 'ItemDate|ItemName', 
e.encounter_datetime 
FROM person p JOIN person_name pn ON p.person_id = pn.person_id
JOIN patient_identifier pi ON p.person_id = pi.patient_id 
JOIN patient_identifier_type pit ON pit.patient_identifier_type_id = pi.identifier_type 
JOIN obs ob ON p.person_id = ob.person_id 
JOIN encounter e ON e.encounter_id = ob.encounter_id 
JOIN concept_name cm ON ob.concept_id = cm.concept_id
JOIN concept co ON ob.concept_id = co.concept_id
JOIN concept_datatype cdt ON cdt.concept_datatype_id = co.datatype_id 
where cm.locale = 'en'
group by 2 limit 10;

综上所述，我认为 OpenMRS 人员不会建议您继续尝试此操作。请改用他们的报告工具。

示例 OpenMRS MySQL 查询以从数据库中读取数据

Sample OpenMRS MySQL query to read data from database

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