R：在 Gephi 中使用的结构标签数据

Question

我准备了一个数据集，其中包含大约 20k 行唯一标识符和约 60 列，如果标签连接到该标识符，则包含布尔信息：

ID   Gender   Tag1   Tag2   Tag3   Tag4   Tag5   Tag6   Tag 7   ...
A    m        0      1      1      0      0      0      0       ...
B    m        1      0      1      0      0      1      0       ...
C    f        1      1      0      0      0      1      1       ...

我想探索 Gephi 中的数据，但不知道使用什么导出 structure/format。为了能够探索标签之间的关系，数据应该是什么样子的？我需要做什么才能到达这个结构？是否需要进一步总结，性别数据可以保留在里面作为属性分析吗？

Answer 1

假设您的数据代表一个网络，这里有一种将其导出为边缘列表 csv 的方法：

df <- read.table(header =T, sep =";", text = "ID;Gender;Tag1;Tag2;Tag3;Tag4;Tag5;Tag6;Tag7
A;m;0;1;1;0;0;0;0
B;m;1;0;1;0;0;1;0
C;f;1;1;0;0;0;1;1")

library(dplyr)
library(tidyr)
library(magrittr)
df %>%
  gather(Target, isTrue, -ID, -Gender) %>%
  filter(isTrue == 1) %>%
  select(-isTrue) %>%
  set_names(c("Source", "Gender", "Target")) %>%
  write.csv(file = file.path(tempdir(), "my.csv"), row.names = FALSE)

你可以将它作为边列表导入到Gephi中，让gephi自动创建节点列表：

R：在 Gephi 中使用的结构标签数据

R: Structure tag data for use in Gephi

r

gephi

network-analysis