列出神经元部分 properties/information 的简单方法?
Easy way to list NEURON section properties/information?
在 NEURON 模拟器中,除了单独遍历每个 属性 之外,是否有更简单的方法来列出部分的属性?
有psection()
方法。一旦感兴趣的部分被 push()
ed。输入 psection()
或从 Python、h.psection(sec=your_section)
将产生以下示例结果:
>>> h.psection(sec=h.Granule[0].soma)
Granule[0].soma { nseg=1 L=8 Ra=80
/*location 0 attached to cell 5*/
/* First segment only */
insert morphology { diam=8}
insert capacitance { cm=4}
insert pas { g_pas=0 e_pas=-65}
insert kamt { gbar_kamt=0}
insert nax { sh_nax=15 gbar_nax=0}
insert na_ion { ena=60}
insert kdrmt { gbar_kdrmt=0}
insert k_ion { ek=-90}
insert Exp2Syn { tau1=5 tau2=50 e=0}
insert IClamp { del=50 dur=200 amp=0.09}
}
如果您使用的是 NEURON gui,您还可以在 NEURON 的控制菜单中找到部分属性:
工具->模型视图
这将打开一个模型视图 window,其中包含部分和段的详细信息,例如:
- 细胞类型:真实细胞/人造细胞
- NetCon 个对象
- LinearMechanisms 个对象
- 密度机制
- 点处理
如果您单击每个 属性,则会出现一个下拉菜单,显示所选 属性 个
的详细信息
如果单击细胞类型(real/artificial 细胞)
,您还可以查看模型的结构
在 NEURON 模拟器中,除了单独遍历每个 属性 之外,是否有更简单的方法来列出部分的属性?
有psection()
方法。一旦感兴趣的部分被 push()
ed。输入 psection()
或从 Python、h.psection(sec=your_section)
将产生以下示例结果:
>>> h.psection(sec=h.Granule[0].soma)
Granule[0].soma { nseg=1 L=8 Ra=80
/*location 0 attached to cell 5*/
/* First segment only */
insert morphology { diam=8}
insert capacitance { cm=4}
insert pas { g_pas=0 e_pas=-65}
insert kamt { gbar_kamt=0}
insert nax { sh_nax=15 gbar_nax=0}
insert na_ion { ena=60}
insert kdrmt { gbar_kdrmt=0}
insert k_ion { ek=-90}
insert Exp2Syn { tau1=5 tau2=50 e=0}
insert IClamp { del=50 dur=200 amp=0.09}
}
如果您使用的是 NEURON gui,您还可以在 NEURON 的控制菜单中找到部分属性:
工具->模型视图
这将打开一个模型视图 window,其中包含部分和段的详细信息,例如:
- 细胞类型:真实细胞/人造细胞
- NetCon 个对象
- LinearMechanisms 个对象
- 密度机制
- 点处理
如果您单击每个 属性,则会出现一个下拉菜单,显示所选 属性 个
的详细信息如果单击细胞类型(real/artificial 细胞)
,您还可以查看模型的结构