使用 "conda install --yes --file requirements.txt" 仅安装可用的包而不会出错

Question

通过以下命令使用 Conda 在 requirements.txt 中安装软件包时

conda install --yes --file requirements.txt

如果 requirements.txt 中的包不可用，则会抛出“无包错误”，如下所示：

Using Anaconda Cloud api site https://api.anaconda.org

Fetching package metadata: ....

Error: No packages found in current linux-64 channels matching: nimfa ==1.2.3

You can search for this package on anaconda.org with
anaconda search -t conda nimfa ==1.2.3

是否可以更改此行为，以便它安装 requirements.txt 中的所有可用软件包，并对不可用的软件包发出警告，而不是抛出错误？

我喜欢这个，因为错误提示的包 nimfa 不可用，可以通过 pip 安装。因此，如果我可以将 conda install --yes --file requirements.txt 的行为更改为仅对不可用的包发出警告，我可以在 .travis.yml 中使用命令 pip install -r requirments.txt 进行跟进，因此 TravisCI 会尝试从任一位置安装它可用的地方。

Answer 1

我最终只是遍历了文件的行

$ while read requirement; do conda install --yes $requirement; done < requirements.txt

编辑：如果你想使用 pip 安装一个包，如果它不能通过 conda 获得，试试这个：

$ while read requirement; do conda install --yes $requirement || pip install $requirement; done < requirements.txt

编辑：如果您使用的是Windows（致谢@Clay）：

$ FOR /F "delims=~" %f in (requirements.txt) DO conda install --yes "%f" || pip install "%f"

Answer 2

您可以按照 this

中的说明进行操作

导出到 .yml 文件

conda env export > freeze.yml

重现：

conda env create -f freeze.yml

Answer 3

对于那些寻找的人，我将其用作@TillHoffmann 的鱼解决方案 shell:

$ while read requirement; conda install --yes $requirement; end < requirements.txt

和

$ while read requirement; conda install --yes $requirement;or pip install $requirement; end < requirements.txt

Answer 4

Pbms 在这里的回答是正确的方法，假设您有一个现有的环境可以复制。 Conda 完全能够同时安装 Conda 包和 pip 包，如 environment.yml 中所列。我想更详细地记录整个过程。请注意，我使用的是基于文件夹的环境，这就是我在大多数命令中添加 --prefix [path to environment folder] 的原因。

假设您将现有项目的环境安装到当前文件夹中名为 env 的文件夹中，如下所示：

conda create --prefix ./env

您将像这样为该项目的环境生成 environment.yml：

conda env export --prefix ./env > environment.yml

您可以在其他文件夹中创建一个新环境，方法是将 environment.yml 复制到那里，然后从那里复制运行这个：

conda env create --prefix ./env --file environment.yml

你会得到一个已经存在的环境来匹配 environment.yml 通过再次复制 environment.yml 到那里，然后从那里运行这个：

conda env update --prefix ./env --file environment.yml --prune

在有问题的环境处于活动状态的情况下，您将像这样验证其包的状态：

conda list

这是该命令可能打印的内容的简化版本（请注意 pip 包标记为 pypi）：

# Name                    Version                   Build  Channel
pip                       19.2.2                   py37_0
python                    3.7.4                h5263a28_0
numpy                     1.16.4           py37h19fb1c0_0
pandas                    0.25.1           py37ha925a31_0
pyodbc                    4.0.27           py37ha925a31_0
ibm-db                    3.0.1                    pypi_0    pypi
ibm-db-sa                 0.3.5                    pypi_0    pypi

最后，这是 environment.yml 的精简版（注意 pip 包列在它们自己的类别中）：

dependencies:
  - pip=19.2.2=py37_0
  - python=3.7.4=h5263a28_0
  - numpy=1.16.4=py37h19fb1c0_0
  - pandas=0.25.1=py37ha925a31_0
  - pyodbc=4.0.27=py37ha925a31_0
  - pip:
    - ibm-db==3.0.1
    - ibm-db-sa==0.3.5

请注意，同时使用 Conda 和 pip 可能会导致胃灼热，因为它们会在不知不觉中消除彼此的依赖关系。您应该先安装所有 Conda 包，然后再安装所有 pip 包，而不是在两者之间交替。如果您的环境中断，官方建议是删除并重新创建它（从您的 environment.yml 文件）。有关详细信息，请参阅本指南：

https://www.anaconda.com/using-pip-in-a-conda-environment/

使用 "conda install --yes --file requirements.txt" 仅安装可用的包而不会出错

Install only available packages using "conda install --yes --file requirements.txt" without error

python

pip

anaconda