SWIG:需要可变字符串类型映射帮助
SWIG: mutable string typemap help needed
这(我希望)是一个非常简单的问题,但是尽管做了一些阅读(我是 SWIG 的新手,而且在 C 方面相当绿色)我还是无法做到 "connection" 在我脑海里。
我有一个库中的函数(遗留代码,不愿编辑):
extern int myfunction(char *infile, char *maskfile, int check, float *median, char *msg)
我的目标是使用 SWIG 在 Python 中为此创建一个包装器。
median
和 msg
变量的值由 C 函数更改。当 return int != 0
那么 msg
arg 中会有一些错误信息。如果 return int == 0
,则 median
变量将包含一个浮点数,其值是从 myfunction
.
分配的
这通常在 return 值为 0 的情况下运行正常。我使用 %array_functions
和 %pointer_functions
创建需要传递的指针,按照这个 .i
文件:
%module test
%include "cpointer.i"
%include "carrays.i"
%{
#include <stdint.h>
%}
extern int myfunction(char *infile, char *maskfile, int check, float *median, char *msg)
%pointer_functions(float, floatp);
%pointer_functions(char, charp);
%array_functions(char, charArray);
swig-ing、编译和链接后,我可以调用python中的函数:
import test
errmsg_buffer = 1024
_infile = 'test2.dat'
infile = imstat.new_charArray(len(_infile))
for i in xrange(len(_infile)):
imstat.charArray_setitem(infile,i,_infile[i])
maskfile = imstat.new_charArray(1)
imstat.charArray_setitem(maskfile,0,'')
check = 0
med = imstat.new_floatp()
errmsg = imstat.new_charArray(errmsg_buffer)
out = test.myfunction(infile,maskfile,check,med,errmsg)
median = test.floatp_value(med)
这有时有效,但通常无效 - 我遇到了很多段错误,这些错误通常通过更改 errmsg_buffer
长度来修复(显然不是一个有用的修复!)。更改 msg
字符串的 C 代码是:
(void)sprintf(errmsg,"file not found");
我的主要问题是正确处理 msg
字符串,我怀疑这是导致段错误的原因(并且可能是由于 new_charArray
的实施不正确?)。
最好的方法是什么?
我可以向 .i
添加一些东西,将 char *msg
转换为 python str
吗?
没有 "pre-initialising" 和 new_CharArray
可以做到吗?如果 errmsg_buffer
太小,我可能会遇到缓冲区溢出。
我希望这是清楚的 - 很高兴添加评论以供进一步讨论。
我不是很学SWIG deeply.But我试着给你一些建议。
1.
如果您的程序修改输入参数或将其用于 return 数据,请考虑使用 SWIG 库一章中描述的 cstring.i 库文件。
数据被复制到新的 Python 字符串中并 returned。
如果您的程序需要处理二进制数据,您可以使用类型映射将 Python 字符串扩展为 pointer/length 参数对。幸运的是,已经定义了这样一个类型映射。只需这样做:
%apply (char *STRING, int LENGTH) { (char *data, int size) };
...
int parity(char *data, int size, int initial);
Python:
parity("e\x09ffss\x00\x00\x01\nx", 0)
如果您需要return 二进制数据,您可以使用cstring.i 库文件。 cdata.i 库也可用于从任意指针中提取额外的二进制数据。
2.I认为"pre-initialising"可能有必要。
使用 SWIG 可以大大简化您的包装器。试试这个 SWIG 接口文件(详情如下):
%module test
%include "typemaps.i"
%include "cstring.i"
%apply float *OUTPUT { float *median };
%cstring_bounded_output(char *msg, 1024);
extern int myfunction(char *infile, char *maskfile, int check, float *median, char *msg);
然后,从python开始,按以下方式使用模块:
import test
infile = 'test2.dat'
maskfile = ''
check = 0
out, median, errmsg = test.myfunction(infile,maskfile,check)
if out == 0: print(errmsg)
...
但是,根据您所写的内容,我不太清楚为什么您的方法会出现段错误。
详情
typemaps.i
文件包含 float *OUTPUT
类型映射,然后将其应用于 float *median
参数并将其从参数转换为 float
输出值。有关详细信息,请参阅 argument handling 上的 SWIG 文档。
cstrings.i
文件包含处理 C 字符串的 SWIG 宏。在这里,我使用了 %cstring_bounded_output
宏。这将创建一个给定大小为 1024 的 char *
缓冲区,并自动将其作为 char *msg
的参数传递。然后,函数完成后的内容被转换为 python 字符串并附加到输出中。有关详细信息,请参阅 here。
SWIG 默认处理前两个 char *
参数,即将 python 字符串转换为适当的 char *
并传递它们。请注意,为这些参数传递的 char *
是不可变的,即,如果您的 myfunction
试图修改这些参数,就会发生不好的事情。了解 SWIG 如何处理 C 字符串 here.
因此,您的包装 myfunction
将如上所示使用,并在 python 中具有以下签名:
myfunction(infile, maskfile, check) -> (out, median, msg)
编辑:
关于 carrays.i
状态的 SWIG 文档:
Note: %array_functions()
and %array_class()
should not be used with types of char
or char *
.
我认为您的代码没有正确创建以 NULL 结尾的 C char *
,所以这可能会导致段错误。
这(我希望)是一个非常简单的问题,但是尽管做了一些阅读(我是 SWIG 的新手,而且在 C 方面相当绿色)我还是无法做到 "connection" 在我脑海里。
我有一个库中的函数(遗留代码,不愿编辑):
extern int myfunction(char *infile, char *maskfile, int check, float *median, char *msg)
我的目标是使用 SWIG 在 Python 中为此创建一个包装器。
median
和 msg
变量的值由 C 函数更改。当 return int != 0
那么 msg
arg 中会有一些错误信息。如果 return int == 0
,则 median
变量将包含一个浮点数,其值是从 myfunction
.
这通常在 return 值为 0 的情况下运行正常。我使用 %array_functions
和 %pointer_functions
创建需要传递的指针,按照这个 .i
文件:
%module test
%include "cpointer.i"
%include "carrays.i"
%{
#include <stdint.h>
%}
extern int myfunction(char *infile, char *maskfile, int check, float *median, char *msg)
%pointer_functions(float, floatp);
%pointer_functions(char, charp);
%array_functions(char, charArray);
swig-ing、编译和链接后,我可以调用python中的函数:
import test
errmsg_buffer = 1024
_infile = 'test2.dat'
infile = imstat.new_charArray(len(_infile))
for i in xrange(len(_infile)):
imstat.charArray_setitem(infile,i,_infile[i])
maskfile = imstat.new_charArray(1)
imstat.charArray_setitem(maskfile,0,'')
check = 0
med = imstat.new_floatp()
errmsg = imstat.new_charArray(errmsg_buffer)
out = test.myfunction(infile,maskfile,check,med,errmsg)
median = test.floatp_value(med)
这有时有效,但通常无效 - 我遇到了很多段错误,这些错误通常通过更改 errmsg_buffer
长度来修复(显然不是一个有用的修复!)。更改 msg
字符串的 C 代码是:
(void)sprintf(errmsg,"file not found");
我的主要问题是正确处理 msg
字符串,我怀疑这是导致段错误的原因(并且可能是由于 new_charArray
的实施不正确?)。
最好的方法是什么?
我可以向 .i
添加一些东西,将 char *msg
转换为 python str
吗?
没有 "pre-initialising" 和 new_CharArray
可以做到吗?如果 errmsg_buffer
太小,我可能会遇到缓冲区溢出。
我希望这是清楚的 - 很高兴添加评论以供进一步讨论。
我不是很学SWIG deeply.But我试着给你一些建议。 1. 如果您的程序修改输入参数或将其用于 return 数据,请考虑使用 SWIG 库一章中描述的 cstring.i 库文件。 数据被复制到新的 Python 字符串中并 returned。 如果您的程序需要处理二进制数据,您可以使用类型映射将 Python 字符串扩展为 pointer/length 参数对。幸运的是,已经定义了这样一个类型映射。只需这样做:
%apply (char *STRING, int LENGTH) { (char *data, int size) };
...
int parity(char *data, int size, int initial);
Python:
parity("e\x09ffss\x00\x00\x01\nx", 0)
如果您需要return 二进制数据,您可以使用cstring.i 库文件。 cdata.i 库也可用于从任意指针中提取额外的二进制数据。
2.I认为"pre-initialising"可能有必要。
使用 SWIG 可以大大简化您的包装器。试试这个 SWIG 接口文件(详情如下):
%module test
%include "typemaps.i"
%include "cstring.i"
%apply float *OUTPUT { float *median };
%cstring_bounded_output(char *msg, 1024);
extern int myfunction(char *infile, char *maskfile, int check, float *median, char *msg);
然后,从python开始,按以下方式使用模块:
import test
infile = 'test2.dat'
maskfile = ''
check = 0
out, median, errmsg = test.myfunction(infile,maskfile,check)
if out == 0: print(errmsg)
...
但是,根据您所写的内容,我不太清楚为什么您的方法会出现段错误。
详情
typemaps.i
文件包含float *OUTPUT
类型映射,然后将其应用于float *median
参数并将其从参数转换为float
输出值。有关详细信息,请参阅 argument handling 上的 SWIG 文档。cstrings.i
文件包含处理 C 字符串的 SWIG 宏。在这里,我使用了%cstring_bounded_output
宏。这将创建一个给定大小为 1024 的char *
缓冲区,并自动将其作为char *msg
的参数传递。然后,函数完成后的内容被转换为 python 字符串并附加到输出中。有关详细信息,请参阅 here。SWIG 默认处理前两个
char *
参数,即将 python 字符串转换为适当的char *
并传递它们。请注意,为这些参数传递的char *
是不可变的,即,如果您的myfunction
试图修改这些参数,就会发生不好的事情。了解 SWIG 如何处理 C 字符串 here.因此,您的包装
myfunction
将如上所示使用,并在 python 中具有以下签名:myfunction(infile, maskfile, check) -> (out, median, msg)
编辑:
关于 carrays.i
状态的 SWIG 文档:
Note:
%array_functions()
and%array_class()
should not be used with types ofchar
orchar *
.
我认为您的代码没有正确创建以 NULL 结尾的 C char *
,所以这可能会导致段错误。