使用 mongolite R 包将 json 对象插入 MongoDB

Question

在 R 中有很多处理 MongoDB 的包。我开始使用 'mongolite' 包，因为我使用 'jsonlite' 和 'mongolite' 构建在上面'jsonlite'。但是，我有点疑惑，为什么在 'mongolite' 中插入函数不允许插入 json 对象（帮助说它插入数据帧）？

我应该使用什么包来存储 json 个对象并进行简单查询？

Answer 1

如果你使用 jsonlite 你仍然可以使用 mongolite 来插入你的数据，但是 只有当 它也可以被强制转换为 data.frame（使用 fromJSON）。例如：

js <- '[
  {
    "id": 1,
    "val": "a"
  },
  {
    "id": 2,
    "val": "b"
  },
  {
    "id": 3,
    "val": "c"
  }
] '


library(jsonlite)
library(mongolite)

mongo <- mongo(collection = "test", db = "test", url = "mongodb://localhost",
      verbose = TRUE)

mongo$insert(fromJSON(js))
# Complete! Processed total of 3 rows.
# [1] TRUE

不过，我的理解是 mongolite 包将仅插入 data.frames。例如，采用更复杂的 JSON 结构，您会发现我们无法使用 mongolite

插入它

js <- '{"foo":[{"id":1,"val":"a"},{"id":2,"val":"b"},{"id":3,"val":"c"}],"bar":[[{"id":1,"val":"a"},{"id":2,"val":"b"},{"id":3,"val":"c"}]]}'

## if we try to insert this using mongolite we get an error
## because it is not a data.frame
> mongo$insert(fromJSON(js))
Error: is.data.frame(data) is not TRUE

要插入更复杂的 JSON 结构，我们可以使用 rmongodb 包中的 mongo.bson.from.json 函数

library(rmongodb)
mongo <- mongo.create()
mongo.is.connected(mongo)
# [1] TRUE

db <- "test"
coll <- "test"

bs <- mongo.bson.from.JSON(js)

mongo.insert(mongo, ns = paste0(db ,".", coll), b = bs)
# [1] TRUE

注意 mongodb 实际上存储 BSON:

MongoDB represents JSON documents in binary-encoded format called BSON behind the scenes. BSON extends the JSON model to provide additional data types and to be efficient for encoding and decoding within different languages

参考：JSON and BSON

Answer 2

mongolite开发版现在支持插入嵌套列表或直接json，见https://github.com/jeroenooms/mongolite/issues/42

您还可以使用 m$iterate() 或 m$iterate()$batch() 查询和取回嵌套列表。

使用 mongolite R 包将 json 对象插入 MongoDB

Inserting json object into MongoDB using mongolite R package

json

r

mongodb

mongolite