[简单问题]:将 .net 文件 (word/occurences) 导入 cytoscape...哪些属性是哪些?

[simple issue]: import .net file (word/occurences) into cytoscape...which attributes are which?

我取了一个文本语料库并将其放入 VosViewer 中,为我创建了一个网络。当我将这个 .net 文件导入 gephi 时,它工作正常:我得到了一个语义网络。虽然我对 select 的哪些属性要导入到 cytoscape 中有点困惑。这是网络的 CSV 文件(.net 导入不起作用),我只需要知道 select 的哪一列是什么。

每一列都可以选择导入为以下之一:

这是您使用的 .net 格式吗? https://gephi.org/users/supported-graph-formats/pajek-net-format/

如果是这样,那么您可以看到该格式(与任何网络文件格式一样)至少需要两列节点标识符,即源和目标。您的屏幕截图清楚地显示了第一列 "id" 以及一些节点属性。 "weight" 和 "cluster" 的 headers 列不太清楚。我天真的猜测是 "weight (occurrences)" 列实际上是 "target" 节点 ID 的第二个列表,而 "weight (co-occurrences)" 是边缘属性。但这只是一个猜测!

如果您可以推断出文件中各列的含义,那么将它们分配并导入 Cytoscape for .net 或任何 tabluar 文件格式就是一件简单的事情。

希望对您有所帮助!

一个选项是从 Gephi 以 GraphML 格式导出您的网络,然后从 Cytoscape 加载它。这将使您忘记血淋淋的转换细节

只需转到 文件类型: 选项下的 File>Export>Graph file 和 select GraphML