read_graph graphml 数据错误：：图形索引太大，值无效

Question

我正在尝试将以下 URL (http://sdi.fish.govt.nz/sdi/mapserver.wfs?SERVICE=WFS&REQUEST=GetFeature&TYPENAME=Annual%20distribution%20of%20Albacore%20tuna&VERSION=1.1.0) 读入 R (3.2.2)。从网站上看，它看起来是 gml 或 graphml 格式。我想将其转换为可用的 shapefile，但我在导入阶段遇到了困难。

library(RCurl)
library(igraph)    
test_url <- 'http://sdi.fish.govt.nz/sdi/mapserver.wfs?SERVICE=WFS&REQUEST=GetFeature&TYPENAME=Annual%20distribution%20of%20Albacore%20tuna&VERSION=1.1.0'
getURL(test_url)
# example of some of the substantial amount of output
# [1] "ï»¿<?xml version=\"1.0\"?><wfs:FeatureCollection xmlns:gml=\"http://www.opengis.net/gml\" xmlns:fish=\"http://www.fish.govt.nz/fish\" xmlns:gmlsf=\"http://www.opengis.net/gmlsf\"
read_graph(testURl, format='graphml')
# Error in .Call("R_igraph_read_graph_graphml", file, as.numeric(index),  : 
# At foreign-graphml.c:1350 : Graph index was too large, Invalid value

是否有解决图表索引过大的方法或读取数据的替代方法？

Answer 1

URL 既不是 GraphML 格式也不是 GML 格式。它有一个名为 gml 的名称空间，但它指的是 Geography Markup Language, not the Graph Markup Language (GraphML) or the Graph Modelling Language（也是 GML）。

read_graph graphml 数据错误：：图形索引太大，值无效

read_graph error with graphml data: : Graph index was too large, Invalid value

r

igraph

rcurl