COMPAS - 节点已填充错误

Question

提交 COMPS 申请后，我收到以下错误消息，申请未执行。

MPI_CMD=mpirun -timestamp-output -n 1 -H s00r0
/apps/COMPSs/1.3/Runtime/scripts/user/runcompss
--project=/tmp/1668183.tmpdir/project_1458303603.xml
--resources=/tmp/1668183.tmpdir/resources_1458303603.xml
--uuid=2ed20e6a-9f02-49ff-a71c-e071ce35dacc
/apps/FILESPACE/pycompssfile arg1 arg2 : -n 1 -H s00r0
/apps/COMPSs/1.3/Runtime/scripts/system/adaptors/nio/persistent_worker_starter.sh
/apps/INTEL/mkl/lib/intel64 null
/home/myhome/kmeans_python/src/ true
/tmp/1668183.tmpdir 4 5 5 s00r0-ib0 43001 43000 true 1
/apps/COMPSs/1.3/Runtime/scripts/system/2ed20e6a-9f02-49ff-a71c-e071ce35dacc : -n 1 -H s00r0
/apps/COMPSs/1.3/Runtime/scripts/system/adaptors/nio/persistent_worker_starter.sh
/apps/INTEL/mkl/lib/intel64 null
/home/myhome/kmeans_python/src/ true
/tmp/1668183.tmpdir 4 5 5 s00r0-ib0 43001 43000 true 2
/apps/COMPSs/1.3/Runtime/scripts/system/2ed20e6a-9f02-49ff-a71c-e071ce35dacc

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All nodes which are allocated for this job are already filled.
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我正在使用 COMPS 1.3。

为什么会这样？

Answer 1

您正在尝试运行同一节点中的主节点和工作节点。带有 NIO 适配器（默认选项）的集群中的 COMPSs 1.3 使用 mpi运行在集群的不同节点中生成主进程和工作进程，而安装在集群中的 mpi运行不允许去做这个。

解决方法如下：

您没有在 enqueue_compss 命令中指定 --tasks_in_master=。
您使用 GAT 适配器 (--comm=integratedtoolkit.gat.master.GATAdaptor) 执行，这有更多的开销

下一个 COMPS 软件版本将使用不同集群资源管理器（如 blaunch、s运行）中可用的 spawn 命令，必须解决此问题

COMPAS - 节点已填充错误

COMPSs - Nodes already filled error

java

mpi

compss

pycompss