R：删除缺少特定百分比值的列

Question

我正在使用类似于以下摘录的数据框。

sample.df

Obs   Var1 Var2 Var3
A0001 21   21   21
A0002 21   78   321
A0003 32   98   87
A0004 21   12   54
A0005 21   13   45 
A0006 21   87   45
B0007 84   NA   45
B0008 21   NA   98
B0009  2   NA   45
B0010 12   NA   45

我想删除缺少一定百分比变量的列，例如 80%。我试过下面的代码：

sample.df.cln <- apply(sample.df, 2, function(x) {
  if (sum(is.na(x)) / nrow(x) > 0.8) {
  x <- NULL  
  }
})

但它返回了以下错误：

Error in if (sum(is.na(x))/nrow(x) > 0.8) { : argument is of length zero

如有任何帮助，我将不胜感激。我也在考虑将代码封装在一个函数中，以便它可以应用于不同的数据帧。

Answer 1

x <- sample.df[ lapply( sample.df, function(x) sum(is.na(x)) / length(x) ) < 0.1 ]

R：删除缺少特定百分比值的列

R: deleting columns where certain percentage of values is missing

r

dataframe

apply

na

missing-data