来自一系列线性模型的预测值

Question

您好：我在使用 tidyr 和 dplyr 构建的数据框中有一系列线性模型。它看起来像下面。我将如何使用一组固定的新数据从每个模型生成预测值？实际上我有 10 个因变量，但只有两个自变量

#random data
x1<-rnorm(100, mean=10, sd=5)
x2<-rnorm(100, mean=5, sd=2 )
y1<-rnorm(100, mean=5, sd=1)
y2<-rnorm(100, mean=3, sd=1)
#create test data farame
df<-data.frame(y1, y2, x1, x2)
#create models
df%>%
  gather(dv, value, y1, y2, -x1,-x2) %>%
  group_by(dv)%>%
  do(mod=lm(value~x1+x2, data=.))

Answer 1

一种选择是使用 do 将预测作为 data.frame 中的一列。与其他答案的不同之处在于使用 data.frame 来获取列中的预测。您可以将 dv 变量添加到此数据集以保持一切正常。

df %>%
    gather(dv, value, y1, y2, -x1,-x2) %>%
    group_by(dv)%>%
    do(mod=lm(value ~ x1 + x2, data=.)) %>%
        do(data.frame(dv = .$dv, pred = predict(.$mod, newdata = df)))

Source: local data frame [200 x 2]
Groups: <by row>

      dv     pred
   (chr)    (dbl)
1     y1 4.936012
2     y1 4.948939
3     y1 4.992472
4     y1 4.733290
5     y1 4.921581
6     y1 5.115699
7     y1 4.981135
8     y1 4.837326
9     y1 4.641484
10    y1 4.739197
..   ...      ...

（对我而言）不利的一面是，您没有用于预测的数据以及实际预测值。您当然可以 cbind 到预测数据集，但另一个有用的选择是使用 do 中包 broom 中的 augment。在第二种选择中，我在第一次调用 do 时使用了 augment，尽管这不是必需的。

您可以给要预测的数据集 with/add 使用 augment 中的 newdata 参数进行预测。在此示例中，我使用了数据集 df2（只是 df 数据集的因变量列）。

library(broom)
df2 = df[ , 3:4] # Dataset for predictions
df %>%
    gather(dv, value, y1, y2, -x1,-x2) %>%
    group_by(dv)%>%
    do( augment(lm(value ~ x1 + x2, data=.), newdata = df2) )

Source: local data frame [200 x 5]
Groups: dv [2]

      dv        x1       x2  .fitted   .se.fit
   (chr)     (dbl)    (dbl)    (dbl)     (dbl)
1     y1  5.863764 6.201406 4.936012 0.1521102
2     y1  4.419014 7.028888 4.948939 0.1936563
3     y1  7.917369 6.081930 4.992472 0.1255001
4     y1  4.338864 4.019565 4.733290 0.1842635
5     y1 13.307611 2.674705 4.921581 0.1757911
6     y1 14.986879 4.666154 5.115699 0.1614377
7     y1 12.941636 3.679022 4.981135 0.1409247
8     y1  7.474526 4.088868 4.837326 0.1310659
9     y1  2.136858 3.706184 4.641484 0.2357699
10    y1  9.307190 1.885127 4.739197 0.2008851
..   ...       ...      ...      ...       ...

来自一系列线性模型的预测值

Predicted values from a series of linear models

r

dplyr

tidyr

broom