在 windows 10 上使用 pip install xx.whl 安装 rpy2

Question

我想在我的 labtop 上使用 rpy2 库。但是我整个上午都没有安装。

这里 post 有几个问题。任何建议将不胜感激！

尝试 1

使用pip install rpy2。结果显示如下：

 Complete output from command python setup.py egg_info:
    Error: Tried to guess R's HOME but no command (R) in the PATH.

    ----------------------------------------
Command "python setup.py egg_info" failed with error code 1 in c:\users\hyf\appdata\local\temp\pip-build-gkdpb0\rpy2\

尝试 2

然后，我读了一些post。还有人说用.whl格式包可以解决问题。所以：使用 pip install rpy2-2.7.8-cp27-none-win_amd64.whl 安装我下载的包。失败：

IOError: [Errno 13] Permission denied: 'D:\Program\Anaconda\Lib\site-packages\rpy2\rinterface\_rinterface.pyd'

尝试 3

使用conda install --channel https://conda.binstar.org/joshadel rpy2，可以安装rpy2包。

但是当我在 ipython 笔记本中这样调用它时：

import rpy2
from rpy2.robjects import r

结果显示错误：

RuntimeError: R_HOME not defined.

但我已经将环境变量添加到系统变量中，如下所示：

R_HOME:D:\Program\R\bin\x64
R_User:D:\Program\Anaconda\Lib\site-packages\rpy2

我正在使用带 Python2.7 内核和 R 3.2.2 的 Anaconda。

Answer 1

显然，R_HOME应该指的是R根目录，从__init__文件中，出现了这些行

# Load the R dll using the explicit path
R_DLL_DIRS = ('bin', 'lib')
# Try dirs from R_DLL_DIRS
for r_dir in R_DLL_DIRS:
    Rlib = os.path.join(R_HOME, r_dir, _win_bindir, 'R.dll')

其中 _win_bindir 指的是 x64 或 32 位版本。因此，从 shell（或更永久地更改系统设置），您可以将环境变量设置为

set R_HOME=D:\Program\R

然后尝试 python（从那个 shell！）。

在 windows 10 上使用 pip install xx.whl 安装 rpy2

Install rpy2 using pip install xx.whl on windows 10

python

r

pip

rpy2

jupyter-notebook

尝试 1

尝试 2

尝试 3