运行 在 .txt 文件上执行多次脚本并将每个输出保存在单个 table 中的 r
run script multiple times on .txt files and save each output in single table in r
我必须 运行 对 100 多个 .txt 文件进行相关性分析。我有一个脚本，它读取单个文件，以我需要的适当方式组织数据，然后将相关值存储为一个新变量。该脚本非常大，因为数据被重新格式化了很多。
我的问题。如何在所有 100 多个 .txt 文件上重复制作此脚本 运行，并将所有 100 多个文件的单个相关值存储在单个 DF 中？理想情况下，最终的 DF 将由两列组成，一列包含 .txt ID，另一列包含相关系数，并且包含 100 多行。
我可以直接复制脚本并将其粘贴到 for 循环中吗？如果是这样，那将如何出现？我是新人！
有任何想法吗？
谢谢！
如 akrun 所述，您可以使用 lapply 执行此操作。没有看到你的数据，我会推荐这样的东西：
my.files <- list.files(pattern = "txt") # use a pattern that only matches the files you want to read in
output <- lapply(my.files, correlation_function)
# Combine list of outputs into a single data.frame
output.df <- do.call(rbind, output)
这假设您有一个名为 correlation_function 的函数，它将文件名作为输入，load 将文件放入 R，运行相关分析，并且 returns一个data.frame.
我必须 运行 对 100 多个 .txt 文件进行相关性分析。我有一个脚本，它读取单个文件，以我需要的适当方式组织数据，然后将相关值存储为一个新变量。该脚本非常大，因为数据被重新格式化了很多。
我的问题。如何在所有 100 多个 .txt 文件上重复制作此脚本 运行，并将所有 100 多个文件的单个相关值存储在单个 DF 中？理想情况下，最终的 DF 将由两列组成，一列包含 .txt ID，另一列包含相关系数，并且包含 100 多行。
我可以直接复制脚本并将其粘贴到 for 循环中吗？如果是这样，那将如何出现？我是新人！ 有任何想法吗？ 谢谢！
如 akrun 所述，您可以使用 lapply 执行此操作。没有看到你的数据，我会推荐这样的东西：
my.files <- list.files(pattern = "txt") # use a pattern that only matches the files you want to read in
output <- lapply(my.files, correlation_function)
# Combine list of outputs into a single data.frame
output.df <- do.call(rbind, output)
这假设您有一个名为 correlation_function 的函数，它将文件名作为输入，load 将文件放入 R，运行相关分析，并且 returns一个data.frame.