igraph：从顶点 igraph r 开始查找连续连接的顶点

Question

输入：

data.frame(from = c(NA, 2, 4, 5, 8, 8, 1),
           to   = c(1, 3, 7, 6, 9, 10, 11))


 from to
   NA  1
    2  3
    4  7
    5  6
    8  9
    8 10
    1 11

我想知道如何用igraphselect一个起始顶点，得到所有连续连接的顶点

例子

select(2) -> c(2, 3)
select(4) -> c(4, 7)
select(1) -> c(1, 11)
select(8) -> c(8, 9, 10)

思路是：不知道终点，只知道起点我想 return 从这一点开始的连续路径

Answer 1

您可以使用 ego 或 all_simple_paths 来查找连接的节点，这会根据您的需要给出略有不同的输出。（ego 给出了指定的邻居一个字符串中的深度，all_simple_paths 按路径方向分隔节点）

#Your example

library(igraph)

g <- graph_from_data_frame(data.frame(from = c(NA, 2, 4, 5, 8, 8, 1),
           to   = c(1, 3, 7, 6, 9, 10, 11)))

 all_simple_paths(g, "2")
# [[1]]
# + 2/12 vertices, named:
# [1] 2 3

 ego(g, length(V(g)), "2")
# [[1]]
# + 2/12 vertices, named:
# [1] 2 3

总计：

ego(g, length(V(g)), as.character(c(1,2,4,8)))

或

lapply(as.character(c(1,2,4,8)) , function(x) all_simple_paths(g, from=x))

igraph：从顶点 igraph r 开始查找连续连接的顶点

igraph: find continuously connected vertices starting from a vertex igraph r

r

igraph