在树状图可视化中删除高度比例

Question

我可以使用

创建树状图

x<-1:100
dim(x)<-c(10,10)
set.seed(1)
groups<-c("red","red", "red", "red", "blue", "blue", "blue","blue", "red", "blue")
x.clust<-as.dendrogram(hclust(dist(x)))

x.clust.dend <- x.clust
labels_colors(x.clust.dend) <- groups
x.clust.dend <- assign_values_to_leaves_edgePar(x.clust.dend, value = groups, edgePar = "col") # add the colors.
x.clust.dend <- assign_values_to_leaves_edgePar(x.clust.dend, value = 3, edgePar = "lwd") # make the lines thick
plot(x.clust.dend)

但是我想把左边高度信息的比例删除如下图。我的猜测是它应该是非常微不足道的，但我无法找到一种方法来做到这一点。我不想要的一种解决方案是使用 ggplot2 如下：

ggplot(as.ggdend(dend2))

这是因为我将放宽一些格式，例如 color_bars()

Answer 1

你可以直接设置yaxt = "n"

plot(x.clust.dend, yaxt = "n")

您可以使用

添加另一个轴

axis(side = 2, labels = FALSE)

Answer 2

图形参数“axes = FALSE”可用于删除 plot.dendogram 命令的距离度量：

plot(x.clust.dend, axes=F)

这将生成以下没有距离轴的树状图：

在树状图可视化中删除高度比例

Delete Scale for Height in dendrogram visualisation

visualization

r

hierarchical-clustering

dendrogram

dendextend