将顶点属性添加到 python 中的加权 igraph Graph

Question

我正在学习 python-igraph，并且在处理划分为组件（它们之间没有连接）的图时遇到困难。当我在此图上应用其中一种聚类算法时，它似乎无法正常工作，因此我需要分别将算法应用于每个子图（组件）。所以为了保持顶点的标识，我想添加一个顶点属性，给我原始图中的 id 号。我的图表由 weighted adjacency 矩阵构成：

import numpy as np
import igraph

def symmetrize(a):
    return a + a.T - 2*np.diag(a.diagonal())

A = symmetrize(np.random.random((100,100)))

G = igraph.Graph.Adjacency(A.tolist(),attr="weight",mode="UPPER")

我看到应该有添加的方法vertex attributes，但是我不知道怎么用..

Answer 1

将顶点属性添加到所有顶点的工作方式如下：

G.vs["attr"] = ["id1", "id2", "id3", ...]

您还可以将顶点属性附加到单个顶点：

G.vs[2]["attr"] = "id3"

例如，如果您只需要所有顶点的唯一标识符，您可以这样做：

G.vs["original_id"] = list(range(G.vcount()))

（如果您在 Python 2.x 上，则不需要 list() 部分，因为 range() 已经生成了一个列表。

将顶点属性添加到 python 中的加权 igraph Graph

Add vertex attributes to a weighted igraph Graph in python

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