使用 loop 和 grep 处理子文件夹

Question

在一堆子文件夹中，如何在遍历数组 {1h2s,1kqf,...} 时仅输入包含特定字符串（例如 1h2s）的子文件夹并执行 grep？子文件夹全名由"oligomerAngle-1h2s" OR 1kqf等加上一串不规则数字组成

Answer 1

使用查找：
find . -type d -name \*1h2s\* -exec grep search {}/* \;

find .在当前目录向下搜索 -type d表示只查找目录 -name \*1h2s\* 仅匹配具有此名称的目录（您需要从 shell 中转义 *） -exec grep search {}/* \; 运行对找到的目录中的每个文件进行 grep

注意：如果找到的目录中没有文件或有子目录，这将导致 grep 出现一些错误消息，如果您不想这样做，可以在命令中添加 2>/dev/null看到他们

Answer 2

终于让这个工作了，也可以使用多个字符串：

find ~/aaPROJECT/helicalPair_ax/selectedPairs/renumberedPdb/clusterPairs-1.25-12-05_windows.12.resle3.2A.RMSD1.3/oligomerAngle/ -type d -name \*1h2s\* -exec grep -E "Distance|Local angle|Average angle" {}/pairsAngles.txt \;

但是尝试了所有现有的在线解决方案后仍无法将结果输出到 txt 文件中...嗯，那是另一个话题了。

使用 loop 和 grep 处理子文件夹

Using loop and grep to deal with subfolders

arrays

grep

loops

subdirectory