Keras: "RuntimeError: Failed to import pydot." after installing graphviz and pydot
Keras: "RuntimeError: Failed to import pydot." after installing graphviz and pydot
我在 windows 10
上使用 Anaconda Python 2.7
我正计划进行 Keras 可视化，所以（当 spyder 打开时）我打开了 Anaconda 命令提示符并 pip 安装了 graphviz 和 pydot。现在，当我尝试 运行 以下内容时：
from keras.models import Sequential
或任何类型的 "from keras." ，我得到错误：
ImportError: cannot import name gof
我已经卸载并重新安装了 Keras、Graphviz 和 pydot。我正在使用 theano 的开发版本。我找不到修复方法。
P.S
如果我卸载 graphviz 和 pydot，keras 又可以工作了
编辑
卸载 anaconda 并重新安装包括 theano、keras、graphviz 和 pydot 后，我现在收到以下错误：
from keras.utils.visualize_util import plot
Using Theano backend.
Using gpu device 0: GeForce GTX 970M (CNMeM is disabled, cuDNN not available)
Traceback (most recent call last):
File "<ipython-input-1-65016ddab3cd>", line 1, in <module>
from keras.utils.visualize_util import plot
File "C:\Anaconda2\lib\site-packages\keras\utils\visualize_util.py", line 8, in <module>
raise RuntimeError('Failed to import pydot. You must install pydot'
RuntimeError: Failed to import pydot. You must install pydot and graphviz for `pydotprint` to work.
我用了pip install graphviz和pip install git+https://github.com/nlhepler/pydot.git
错误消息有点误导，如您所见here。问题是没有安装graphviz
但是你提到 graphviz 是使用 pip 安装的。这也是一种误导，因为 graphviz 包只是一个 python 包装器，graphviz binaries 必须单独安装才能使 python 包装器工作。
我遇到了同样的问题。我在 Ubuntu 上使用 Anaconda python。但似乎 Keras 使用系统的 python 而不是 Anaconda python。最初，我使用 conda 安装了 pydot 和 graphviz。当我在系统的 python（使用 /usr/bin/pip 安装 pydot）中安装 pydot 和 graphviz 时，它工作正常。
我的 Keras（没有 anaconda）也有类似的问题。我已经用这种方式解决了我的问题
sudo pip install pydot
sudo pip install graphviz
sudo add-apt-repository ppa:gviz-adm/graphviz-dev
sudo apt-get update
sudo apt-get install graphviz-dev
在osxbrew install graphviz中通过brew安装graphviz，对于ubuntu使用apt-get install graphviz，不需要通过pip安装graphviz。
Keras 2.0.6 寻找 pydot-ng（维护得更好），如果找不到，则回退到 pydot。我通过从 source 安装 pydot-ng 解决了这个问题。
如果您使用的是 Anaconda 环境，您最好通过 conda install.
安装 pydotplus 和 graphviz
conda install graphviz
conda install pydotplus
注意：
你最好将你的 Keras 更新到最新版本（2.0.9+），它会自动检查并选择使用 pydotplus、pydot-ng、pydot 中的哪一个。 pydot-ng很久没人维护了，只支持py3.4-和py2.7
对于 Mac 上的 Anaconda：
使用 conda 安装这个包 运行:
conda install -c anaconda graphviz
安装graphviz到系统。从 here 或 Mac:
下载软件包
brew install graphviz
安装 python pydot-ng 和 graphviz 包装器。
pip install pydot-ng graphviz
conda install -c anaconda pydot-ng #Anaconda user
在代码中使用 pydot-ng
import pydot_ng as pydot
如果Keras visualization utils仍然使用pydot，尝试在visualize_util.py
import pydot更改为import pydot_ng as pydot
1)康达安装graphviz
2）pip 安装 graphviz
3）pip 安装 pydot
然后：
import os
os.environ["PATH"] += os.pathsep + AppData\Local\Continuum\anaconda3\envs\tensorflow\Library\bin\graphviz'
我做的就是跟着做的
import keras
import pydotplus
from keras.utils.vis_utils import model_to_dot
keras.utils.vis_utils.pydot = pydot
plot_model(your_model_name, to_file='model.png')
这对我有用。
在 mac 蟒蛇 python=3.6.8
下面的代码在 jupyter/tensorflow-notebook docker 容器中运行的 jupyter notebook 中运行。
!conda install -y graphviz pydotplus
import pydotplus
import keras.utils
keras.utils.vis_utils.pydot = pydotplus
keras.utils.plot_model(your_model_name, to_file='model.png', show_shapes=True)
你需要告诉keras使用pydotplus
如果你是通过pip安装的，则与pydot或graphviz无关
您应该去下载 graphviz brinary 并安装。
不要忘记将 bin 文件夹添加到您的路径中：C:/Program Files (x86)/Graphviz2.38/bin/
然后关闭并重新打开您的控制台。
安装 pydot 和 graphviz 并将 graphviz 添加到路径后，您可以重新启动 IDE 或终端。 see here.
我在 windows 10
上使用 Anaconda Python 2.7我正计划进行 Keras 可视化，所以（当 spyder 打开时）我打开了 Anaconda 命令提示符并 pip 安装了 graphviz 和 pydot。现在，当我尝试 运行 以下内容时：
from keras.models import Sequential
或任何类型的 "from keras." ，我得到错误：
ImportError: cannot import name gof
我已经卸载并重新安装了 Keras、Graphviz 和 pydot。我正在使用 theano 的开发版本。我找不到修复方法。
P.S
如果我卸载 graphviz 和 pydot，keras 又可以工作了
编辑
卸载 anaconda 并重新安装包括 theano、keras、graphviz 和 pydot 后，我现在收到以下错误：
from keras.utils.visualize_util import plot
Using Theano backend.
Using gpu device 0: GeForce GTX 970M (CNMeM is disabled, cuDNN not available)
Traceback (most recent call last):
File "<ipython-input-1-65016ddab3cd>", line 1, in <module>
from keras.utils.visualize_util import plot
File "C:\Anaconda2\lib\site-packages\keras\utils\visualize_util.py", line 8, in <module>
raise RuntimeError('Failed to import pydot. You must install pydot'
RuntimeError: Failed to import pydot. You must install pydot and graphviz for `pydotprint` to work.
我用了pip install graphviz和pip install git+https://github.com/nlhepler/pydot.git
错误消息有点误导，如您所见here。问题是没有安装graphviz
但是你提到 graphviz 是使用 pip 安装的。这也是一种误导，因为 graphviz 包只是一个 python 包装器，graphviz binaries 必须单独安装才能使 python 包装器工作。
我遇到了同样的问题。我在 Ubuntu 上使用 Anaconda python。但似乎 Keras 使用系统的 python 而不是 Anaconda python。最初，我使用 conda 安装了 pydot 和 graphviz。当我在系统的 python（使用 /usr/bin/pip 安装 pydot）中安装 pydot 和 graphviz 时，它工作正常。
我的 Keras（没有 anaconda）也有类似的问题。我已经用这种方式解决了我的问题
sudo pip install pydot
sudo pip install graphviz
sudo add-apt-repository ppa:gviz-adm/graphviz-dev
sudo apt-get update
sudo apt-get install graphviz-dev
在osxbrew install graphviz中通过brew安装graphviz，对于ubuntu使用apt-get install graphviz，不需要通过pip安装graphviz。
Keras 2.0.6 寻找 pydot-ng（维护得更好），如果找不到，则回退到 pydot。我通过从 source 安装 pydot-ng 解决了这个问题。
如果您使用的是 Anaconda 环境，您最好通过 conda install.
pydotplus 和 graphviz
conda install graphviz
conda install pydotplus
注意：
你最好将你的 Keras 更新到最新版本（2.0.9+），它会自动检查并选择使用 pydotplus、pydot-ng、pydot 中的哪一个。 pydot-ng很久没人维护了，只支持py3.4-和py2.7
对于 Mac 上的 Anaconda：
使用 conda 安装这个包 运行:
conda install -c anaconda graphviz
安装
下载软件包graphviz到系统。从 here 或 Mac:brew install graphviz安装 python pydot-ng 和 graphviz 包装器。
pip install pydot-ng graphviz conda install -c anaconda pydot-ng #Anaconda user在代码中使用
pydot-ngimport pydot_ng as pydot如果Keras visualization utils仍然使用pydot，尝试在
visualize_util.py中将
import pydot更改为import pydot_ng as pydot
1)康达安装graphviz
2）pip 安装 graphviz
3）pip 安装 pydot
然后：
import os
os.environ["PATH"] += os.pathsep + AppData\Local\Continuum\anaconda3\envs\tensorflow\Library\bin\graphviz'
我做的就是跟着做的
import keras
import pydotplus
from keras.utils.vis_utils import model_to_dot
keras.utils.vis_utils.pydot = pydot
plot_model(your_model_name, to_file='model.png')
这对我有用。 在 mac 蟒蛇 python=3.6.8
下面的代码在 jupyter/tensorflow-notebook docker 容器中运行的 jupyter notebook 中运行。
!conda install -y graphviz pydotplus
import pydotplus
import keras.utils
keras.utils.vis_utils.pydot = pydotplus
keras.utils.plot_model(your_model_name, to_file='model.png', show_shapes=True)
你需要告诉keras使用pydotplus
如果你是通过pip安装的，则与pydot或graphviz无关
您应该去下载 graphviz brinary 并安装。
不要忘记将 bin 文件夹添加到您的路径中：C:/Program Files (x86)/Graphviz2.38/bin/
然后关闭并重新打开您的控制台。
安装 pydot 和 graphviz 并将 graphviz 添加到路径后，您可以重新启动 IDE 或终端。 see here.