交互式 ggplotly 图形不是从 R 中的 `Rmd` 文件中的 `for` 循环内部绘制的

Question

我试图在 R markdown (.Rmd) 文件中从 for 循环内部绘制一系列交互式 ggplotly 图。我的 .Rmd 文件的内容：

---
title: "Untitled"
output: html_document
---

```{r}
library(ggplot2) # for plots
library(plotly)  # for interactive plots

# Convert 4 variables to factor variables:
factor_vars <- c("vs", "am", "gear", "carb")
mtcars[factor_vars] <- data.frame(Map(as.factor, mtcars[factor_vars])) 



for (VAR in factor_vars) {
    cat(paste("Factor variable:", VAR))
    # Contents of "VAR" changes inside the loop
    p <- ggplot(mtcars, aes_string(x = "mpg", y = "wt", color = VAR)) + geom_point()

    # Print an interactive plot
    print(ggplotly(p))
}

```

我在 RStudio 中按下 Knit HTML 按钮。不幸的是，none 的交互式图出现在 .html 文件中。

问题：为什么没有绘制图表？以及如何在 Rmd 文件中结合 for 循环创建交互式绘图？

p.s。如果我使用 print(p) 而不是 print(ggplotly(p))，ggplot2 图会出现在生成的 .html 文件中。

Answer 1

基于这个github issue，你应该可以做这样的事情：

  ---
  title: "Untitled"
  output: html_document
  ---

  ```{r, message = F}
  library(ggplot2) # for plots
  library(plotly)  # for interactive plots

  # Convert 4 variables to factor variables:
  factor_vars <- c("vs", "am", "gear", "carb")
  mtcars[factor_vars] <- data.frame(Map(as.factor, mtcars[factor_vars])) 

  plt <- htmltools::tagList()
  i <- 1
  for (VAR in factor_vars) {

      # Contents of "VAR" changes inside the loop
      p <- ggplot(mtcars, aes_string(x = "mpg", y = "wt", color = VAR)) + 
        geom_point() + 
        ggtitle(paste("Factor variable:", VAR))


      # Print an interactive plot
      # Add to list
      plt[[i]] <- as.widget(ggplotly(p))
      i <- i + 1
  }

  ```

  ```{r, echo = F}
  plt
  ```

交互式 ggplotly 图形不是从 R 中的 `Rmd` 文件中的 `for` 循环内部绘制的

Interactive `ggplotly` graph is not plotted from inside `for` loop in `Rmd` file in R

r

ggplot2

knitr

plotly

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