将所有相关加入整合到其根访问中的脚本

Question

我有大数据关注；

KEL_1021159,K00001
KEL_1020176,K00001
KEL_1018609,K00001
KEL_1008140,K00006
KEL_1012058,K00006
KEL_1018645,K00006
KEL_1004034,K00006
KEL_1004235,K00006

我目前正在尝试将其转换成这样；

KEL_1021159,KEL_1020176,KEL_1018609 K00001
KEL_1008140,KEL_1012058,KEL_1018645,KEL_1004034,KEL_1004235 K00006

是否有用于此目的的基本脚本？

Answer 1

使用 awk 非常简单：

awk -F, '
    {a[] = a[]  FS}
    END {
        for (key in a) {
            sub(/,$/, "", a[key])
            print a[key], key
        }
    }
' file

不透明的 perl 一行代码：

perl -F, -ane 'push @{$a{$F[1]}},$F[0]}{print join(",",@{$a{$_}})." ".$_ for keys %a' file

将所有相关加入整合到其根访问中的脚本

Script to bring together all relevant accession into its root access

bash

awk

tabular