当我在我的函数中使用另一个包的函数时,我应该放什么 roxygen

What roxygen should I put when I use a function of another package in my function

我正在编写许多函数,我正在尝试使用 roxygen2

进行记录

我经常使用futile.logger包,比如说我在函数中使用flog.debug函数。我应该用什么 @* 来记录它?

首先,了解您的

sessionInfo() 
getwd() # your R's working directory
.libPaths() # your R's library location

Step0下载并安装必要的包:

library(roxygen2)
library(devtools)
library(digest)

Step1 将所有相关的“.R”文件(yourfunction1.R、yourfunction2.R、yourfunction3.R)放入 R 的工作目录。

Step2 在 R 的工作目录中创建包框架: 确保在 运行 以下命令之前 R 的工作目录中没有名为 "yourpackage" 的文件夹。 (来自 R 的控制台)

package.skeleton(name = "yourpackage", code_files = c("yourfunction1.R", "yourfunction2.R", "yourfunction3.R"), path = ".")

在 运行 package.skeleton 之后,将在您的 R 工作目录中创建文件夹 yourpackage。

从 Windows 资源管理器中删除 Read-and-delete-me 文件。
删除 YourR'sWorkingDirectory\yourpackage\man 文件夹
中的 "yourpackage-package.Rd" 文件 (请勿删除 YourR'sWorkingDirectory\yourpackage\man 文件夹中的 "yourpackage.Rd" 文件!)

Step3 在“.R”文件 (yourfunction.R) 的序言​​末尾,放置以下内容(如果您在第 1 步中没有这样做的话) ):

#' @importFrom futile.logger flog.debug
#' @export
yourfunction <- function(...) {...

Step4 在你的包的 DESCRIPTION 文件中,在 Imports 部分,添加:

Imports:
    futile.logger(>= VersionNumber)

其中 VersionNumber 是您正在使用的 futile.logger 包的版本号。您可以通过在 RevolutionREnterprise 的对象浏览器中右键单击任何函数(来自您的包)来查找版本号;并转到生成的 .html 帮助文件的底部。在那里,显示了包的版本号。

在Step2中,package.skeleton自动生成了一个NAMESPACE文件,其内容为:

exportPattern("^[[:alpha:]]+")

不要手动处理这个 NAMESPACE 文件。

Step5 对你想要创建的包进行 roxygenize ("yourpackage")

library(roxygen2)
roxygenize("yourpackage")

在 roxygenization 后,你的包的 NAMESPACE 文件的内容会自动从 exportPattern("^[[:alpha:]]+") 转换为

# Generated by roxygen2: do not edit by hand

export(yourfunction)
importFrom(futile.logger,flog.debug)

Step6 构建你的包:
(首先,从 Windows Explorer 中删除 YourR'sWorkingDirectoryFolder\yourpackage 文件夹中的 "src-i386" 和 "src-x64" 文件夹(如果有))
(再次确定YourR'sWorkingDirectory\yourpackage\man文件夹中没有"yourpackage-package.Rd"文件,如果有,在构建前删除)

build("yourpackage")

Step7 安装你的包:

install("yourpackage")

第 8 步 通过加载您的包和 运行 包中的函数来检查一切是否正常。

library(yourpackage)
yourfunction(6,1,2) # "yourfunction" is a function in the package "yourpackage"

Step9 检查你的包是否可以加载到 CRAN(综合 R Archieve 网络)(如果你想分享你的包):

(首先,从 Windows 资源管理器中删除 YourR'sWorkingDirectoryFolder\yourpackage 文件夹中的 "src-i386" 和 "src-x64" 文件夹(如果有))
(再次确定YourR'sWorkingDirectory\yourpackage\man文件夹中没有"yourpackage-package.Rd"文件,如果有请删除后再查看)

来自 DOS 命令提示符:
开始——cmd——回车。传递到 R 的工作目录(您的 R 的工作目录通过 getwd() 知道)并进行 CRAN 检查:

cd C:\Users\User\Documents\Revolution
R CMD check yourpackage

来自 R 的控制台:

devtools::check("C:/Users/User/Documents/Revolution/yourpackage")