如何向 IPython（笔记本）shell 命令提供内联输入？

Question

我想将 IPython 笔记本与一些 shell 命令及其输入放在一起。在 bash 提示符下我可以使用 "here-document" 语法：

bash-3.2$ mysql -u root <<END_IPUT
> use mydb;
> show tables;
> END_INPUT

如何在 IPython 中获得相同的效果，特别是在 jupyter notebook 中？我知道如何执行 shell 命令作为 IPython 作为 "line magics" 或“单元格魔法”，例如：

In [7]:  !! ls -tF
Out[7]:  ['Demo-notebook.ipynb',
          'createdb.sql',
          ...

我查看了 IPython as a system shell，它展示了如何启用一些语法细节。在以下之后，我可以运行系统命令而无需预先添加 ! 或 !!

# Turn everything in $PATH into an alias; 
# then enable calling aliases without ! or %
%rehashx      
%autocall 2

但是 none 这有助于为这些内联命令提供输入：此处文档语法在 IPython 中无效，并导致 python SyntaxError .那我该怎么做呢？

Answer 1

bash 单元格魔法允许您输入多行 bash。只需以 %%bash:

开始任何单元格

%%bash
echo "This is bash"
ls

如果您使用 heredoc 将文本通过管道传输到另一个程序，您还可以使用脚本单元魔术：

%%script bc
2+3

可能还有其他细胞魔法可以更具体地解决您的问题！

Answer 2

通过更多的研究，并借助@ThomasK 的提示（参见接受的答案），我找到了几种方法来做到这一点。

一个解决方案是细胞魔法%sx。它将单元格内容作为 bash 脚本执行，并捕获和 returns 输出作为行列表。有时方便，有时不方便。

In[1]:  %%sx
        echo Hello, world
        cat -n <<DATA
        this
        and that
        DATA

Out[1]: ['Hello, world', '     1\tthis', '     2\tand that']

按照 @ThomasK 的建议将其更改为 %%bash，输出将打印出来，而不是返回。为了捕获它以供进一步处理，ipython 提供了 --out 参数。但是我需要自己打印它——默认情况下它不会显示。
```
In[1]:  %%bash --out var
        echo Hello, world
        echo "   Again"

In[2]:  var

Out[2]: 'Hello, world\n   Again\n'
```
%%bash 实际上是 %%script bash 的 shorthand，据称工作 "like the #! line in a script"（请参阅 %%script? 的帮助）。它是做什么的。因此，这里介绍了如何免除 here-document 语法并让任何程序读取单元格内容作为输入。 %%script 也接受 --out 参数。
```
        %%script --out var mysql -u root -p XYZ
        USE somedb;
        SELECT * FROM users
             WHERE passwd IS NULL\G
```

这很好，但我最终没有使用它，因为我的用例是 mysql，最终我发现有一个很棒的第三方 ipython-sql 扩展可以代替:

%load_ext sql
%sql mysql+pymysql://user:passwd@localhost/somedb

这以安装扩展为前提，pip install ipython-sql。对于 mysql，我还需要 pip install pymysql。经过上面的设置，我就这样和数据库对话了

In[1]:  %%sql 
        SELECT * FROM users
            WHERE passwd IS NULL

Out[1]: 1 rows affected.
        ...

返回的table其实是画成带边框的笔记本table，挺好看的。它作为 Pandas 数据框（智能列表）提供，我可以从 _ 中获取它。

如何向 IPython（笔记本）shell 命令提供内联输入？

How do I provide inline input to an IPython (notebook) shell command?

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ipython-notebook

ipython-magic

jupyter-notebook