如何从 python 中的字典生成图的邻接矩阵?

How do I generate an adjacency matrix of a graph from a dictionary in python?

我有以下词典:

g = {
'A': ['A', 'B', 'C'], 
'B': ['A', 'C', 'E'], 
'C': ['A', 'B', 'D'],
'D': ['C','E'],
'E': ['B','D']
}

它实现了一个图,每个列表包含图顶点的邻居(字典键是顶点本身)。 我有麻烦了,我想不出从邻居列表中获取图形邻接矩阵的方法,可能很容易,但我是 python 的新手,希望有人能帮助我!我正在使用 Python 3.5

我需要生成以下矩阵:

这是使用 pandas 的解决方案。

import pandas as pd

g = {
'A': [ 'A', 'B', 'C'], 
'B': [ 'A', 'C', 'E'], 
'C': [ 'A', 'B ',' D '], # I added a comma here
'D': [' C ',' E '],
'E': [' B ',' D ']
}

# clean up the example
g = {k: [v.strip() for v in vs] for k, vs in g.items()}

edges = [(a, b) for a, bs in g.items() for b in bs]

df = pd.DataFrame(edges)

adj_matrix = pd.crosstab(df[0], df[1])

# 1  A  B  C  D  E
# 0               
# A  1  1  1  0  0
# B  1  0  1  0  1
# C  1  1  0  1  0
# D  0  0  1  0  1
# E  0  1  0  1  0

我不确定为什么您的示例矩阵中的 (A, A) 位置有 2。

没有pandas

keys=sorted(g.keys())
size=len(keys)

M = [ [0]*size for i in range(size) ]

for a,b in [(keys.index(a), keys.index(b)) for a, row in g.items() for b in row]:
     M[a][b] = 2 if (a==b) else 1

M

[2, 1, 1, 0, 0],
[1, 0, 1, 0, 1],
[1, 1, 0, 1, 0],
[0, 0, 1, 0, 1],
[0, 1, 0, 1, 0]]

说明

for a, row in g.items() 迭代字典中的 key:value 条目,for b in row 迭代值。如果我们使用 (a,b),这将给我们所有的对。

(keys.index(a), keys.index(b)) 但是我们需要索引赋值给对应的矩阵项,

keys=sorted(g.keys()) 这就是我们提取和排序键的原因。

for a,b in... 获取索引条目并根据对角线元素或不分配值 1 或 2。

M = [ [0]*size for ... 初始化前不能使用矩阵。

import numpy as np
mat = np.zeros(shape = (len(g), len(g)))
for k, vs in g.items():
    for v in vs:
        if v in g[k]:
            mat[k][v] = 1