如何使用定义的颜色绘制 igraph 社区？

Question

我可以使用下面的代码来生成和绘制社区：

 wc <- walktrap.community(subgraph)
 modularity(wc)
 membership(wc)

 layout <-layout.fruchterman.reingold(subgraph)

 plot(wc, subgraph,  layout=layout, vertex.label=NA, vertex.size=5, edge.arrow.size=.2)

但是，社区的颜色是自动的，我有两个问题：

我可以自定义社区颜色吗？
我可以在社区区添加一些文字吗？

Answer 1

是的，你可以做这两件事。根据节点所在的模块更改节点的颜色（以及更改模块周围多边形的颜色）使用 plot.igraph 中的参数非常简单。向模块添加文本并非易事，据我所知，最简单的解决方案是手动向绘图添加文本。

library(igraph)

# Generate random graph and community structure
set.seed(23)
g <- sample_gnm(15, 45)
wc <- walktrap.community(g)

# Plot
par(mfrow=c(1,2), mar=rep(1,4))
layout <-layout.fruchterman.reingold(g)
plot(wc, g, layout=layout, vertex.label=NA, vertex.size=5,  edge.arrow.size=.2)

# Change colors of nodes, polygons, and polygon borders
new_cols <- c("white", "red", "black")[membership(wc)]
plot(wc, g, col=new_cols, mark.border="black", mark.col=c("tan", "pink", "lightgray"), 
    layout=layout, vertex.label=NA, vertex.size=5, edge.arrow.size=.2)

# Add labels
text(c(-1.15, 0.8, 0.9), c(0.35, -0.7, 0.8), c("A", "B", "C"))

如何使用定义的颜色绘制 igraph 社区？

How can I plot igraph community with defined colors?

r

igraph