在 R 中使用 'Intro to Caret' Vignette 示例代码时出错

Question

您可以从插入符号 CRAN 页面下载 "Intro to Caret" 小插图 (pdf)，我正在绑定运行一个带有内置数据的简单示例。

我收到以下错误：

Error in { : 
  task 1 failed - "unused arguments (type = "prob", ncomp = modelFit$tuneValue$ncomp)"
In addition: There were 30 warnings (use warnings() to see them)

所有的 warnings() 似乎都遵循这种模式：

30: In eval(expr, envir, enclos) :
  predictions failed for Fold10.Rep3: ncomp=15 Error in predict(modelFit, newdata, type = "class") : 
  unused argument (type = "class")

我还有其他插入符号示例在工作，这似乎提出了试图预测一个因素的逻辑回归问题。您应该能够重现：

library(mlbench)
library(caret)

data(Sonar)
set.seed(1)

inTrain <- createDataPartition(y = Sonar$Class, p = 0.75, list = FALSE)

training <- Sonar[inTrain,]
testing <- Sonar[-inTrain,]

ctrl <- trainControl(method = "repeatedcv",
                     repeats = 3,
                     classProbs = TRUE,
                     summaryFunction = twoClassSummary)

model <- train(Class ~ .,
               data = training,
               method = "pls",
               tuneLength = 15,
               trControl = ctrl,
               metric = "ROC",
               preProc = c('center', 'scale'))

我正在使用 R 版本 3.3

解释此错误消息有什么想法吗？任何其他帖子似乎都指向 data.frame 的格式，但这是内置数据和文档示例。

Answer 1

根据评论中的反馈，它可以在其他平台上运行，我选择清除 R 并重新安装并重新安装所有软件包，并解决了这个问题。我偶尔会看到它出现，它似乎有助于清理工作区。

在 R 中使用 'Intro to Caret' Vignette 示例代码时出错

Error Using 'Intro to Caret' Vignette Sample Code in R

r

r-caret