Link 带有 Jupyter Notebook 的 Conda 环境

Question

我正在努力为 python 做一些科学工作创造一个良好的环境。为此，我安装了 Jupyter 和 miniconda。

然后我希望能够拥有不同的环境并将它们与 Jupyter 笔记本一起使用。所以我用 conda 创建了两个自定义环境：py27 和 py35。

> conda env list
# conda environments:
#
py27                     /Users/***/miniconda3/envs/py27
py35                     /Users/***/miniconda3/envs/py35
root                  *  /Users/***/miniconda3

然后在我的笔记本上我有两个内核 python 2 和 python 3。在笔记本中，我使用 python3 内核得到以下信息：

> import sys
> print(sys.executable)
/Users/***/miniconda3/envs/py35/bin/python

还有 python2 内核：

> import sys
> print(sys.executable)
/usr/local/opt/python/bin/python2.7

如何将 sys.executable 设置为 python2 的 miniconda 环境？
如何将 conda env 与笔记本内核绑定？
正在做 source activate py35 有 link 和 jupyter notebook 吗？

我想我真的错过了什么。

谢谢大家

--- 编辑

我有多个 jupyter bin :

> where jupyter
/usr/local/bin/jupyter
/usr/local/bin/jupyter
/Users/ThomasDehaeze/miniconda3/bin/jupyter

我这里只有一个内核/usr/local/share/jupyter/kernels/python2。但是在 Jupyter 内部，我有两个内核，python2 和 python3。我在哪里可以找到另一个？

我从 /usr/local/share/jupyter/kernels/python2 修改了 kernel.json :

{
 "display_name": "Python 2",
 "language": "python",
 "argv": [
  "/Users/***/miniconda3/envs/py27/bin/python2.7",
  "-m",
  "ipykernel",
  "-f",
  "{connection_file}"
 ]
}

然后：

import sys
print(sys.executable)
/usr/local/opt/python/bin/python2.7

所以什么都没有改变

Answer 1

我找到了解决方案。位于此处 ~/Library/Jupyter/kernels/.

的内核设置

然后我修改了kernel.json文件，设置正确的路径为python。

现在可以了。

Answer 2

对于 Anaconda，我建议您使用更简单、更合适的解决方案；看看 nb_conda_kernels package.

它允许您“在 Jupyter Notebook 中管理基于 conda 环境的内核”。

自 Anaconda 版本 4.1.0 起应包括在内，否则只需使用

conda install nb_conda

现在您应该可以直接从笔记本界面管理所有内容了。

请注意，只有安装了 Jupyter 内核的环境（在 Python 的情况下，ipykernel 包）。引自 nb_conda_kernels GitHub 页面：

Any other environments you wish to access in your notebooks must have an appropriate kernel package installed. For instance, to access a Python environment, it must have the ipykernel package; e.g.
conda install -n python_env ipykernel

Answer 3

不确定还有什么帮助，但对我来说至关重要的是在根 conda 环境中安装 nb_conda_kernels。尝试在特定的 conda 环境中安装它并没有让 Jupyter Notebook 能够使用默认环境以外的其他 conda 环境。

conda install -n root nb_conda_kernels

jupyter notebook

Answer 4

假设您的 conda-env 被命名为 cenv，它很简单：

    $ conda activate cenv
    (cenv)$ conda install ipykernel
    (cenv)$ ipython kernel install --user --name=<any_name_for_kernel>
    (cenv($ conda deactivate

如果您重新启动 jupyter notebook/lab，您将能够看到可用的新内核。

PS: 如果您使用的是 virtualenv 等，上述步骤适用。

Answer 5

这对我有用：

source activate {environment_name}
python -m ipykernel install --user --name={environment_name};

如果没有安装ipykernel，使用这个命令：

conda install -c anaconda ipykernel

Answer 6

对我有用的是：创建虚拟环境，安装 ipykernel，在 jupyter 内核中注册虚拟环境并加载 jupyter notebook：

$ conda create -n testEnv python=3.6
$ conda activate testEnv
(testEnv)$ conda install ipykernel
(testEnv)$ ipython kernel install --user --name=testEnv
(testEnv)$ jupyter notebook

之后，在jupyter notebook中你应该可以在其他内核列表中找到创建的环境

Link 带有 Jupyter Notebook 的 Conda 环境

Link Conda environment with Jupyter Notebook

python

ipython

jupyter

jupyter-notebook

miniconda