如何用seaborn拟合泊松分布?

How to fit a poisson distribution with seaborn?

我尝试使我的数据服从泊松分布:

import seaborn as sns
import scipy.stats as stats

sns.distplot(x, kde = False, fit = stats.poisson)

但是我得到这个错误:

AttributeError: 'poisson_gen' 对象没有属性 'fit'

其他分布(gamma 等)效果很好。

Poisson distribution (implemented in scipy as scipy.stats.poisson) is a discrete distribution。 scipy 中的离散分布没有 fit 方法。

我对 seaborn.distplot 函数不是很熟悉,但它似乎假设数据来自连续分布。如果是这样,那么即使 scipy.stats.poisson 有一个 fit 方法,传递给 distplot.

也不是一个合适的分布

问题标题是 "How to fit a poisson distribution with seaborn?",因此为了完整起见,这里提供一种获取数据图及其拟合的方法。 seaborn 仅用于条形图,使用@mwaskom 的建议使用 seaborn.countplot。拟合实际上是微不足道的,因为泊松分布的最大似然估计只是数据的平均值。

首先,进口:

In [136]: import numpy as np

In [137]: from scipy.stats import poisson

In [138]: import matplotlib.pyplot as plt

In [139]: import seaborn

生成一些要使用的数据:

In [140]: x = poisson.rvs(0.4, size=100)

这些是 x 中的值:

In [141]: k = np.arange(x.max()+1)

In [142]: k
Out[142]: array([0, 1, 2, 3])

使用seaborn.countplot绘制数据:

In [143]: seaborn.countplot(x, order=k, color='g', alpha=0.5)
Out[143]: <matplotlib.axes._subplots.AxesSubplot at 0x114700490>

泊松参数的最大似然估计就是数据的均值:

In [144]: mlest = x.mean()

使用poisson.pmf()得到预期概率,乘以数据集的大小得到预期计数,然后使用matplotlib作图。条形是实际数据的计数,点是拟合分布的预期计数:

In [145]: plt.plot(k, poisson.pmf(k, mlest)*len(x), 'go', markersize=9)
Out[145]: [<matplotlib.lines.Line2D at 0x114da74d0>]