使用标签提取 Igraph 中的所有三角形

Question

我创建了一个有 1000 条边的 igraph。我的目标是提取在该 igraph 中找到的所有三角形，但包括标签而不是数字。我还希望它采用具有 3 列的数据框形式（三角形的每个节点一列）

我试过简单地调用：

triangles(graph)

这会返回一个列表，所有名称都在一列中：

+ 28431/204 vertices, named:
    [1] node_a                                                
    [2] node_b                   
    [3] node_c 
    [4] node_a                                                
    [5] node_b                   
    [6] node_d                 
    [7] node_a                                                
    [8] node_b                   
    [9] node_e                              
   [10] node_a                                                
+ ... omitted several vertices

当我尝试时：

adjacent.triangles(graph)

它returns所有数字但不是节点的名称：

[1]  15 103  45 121 152  78 325 325   3  35  90   0 488 283   3   0 325 325 325 325  78  21 190   3
[25] 133   0  47 167 167   6   3 325 505 415   0  36  78 325  78  78  90   6 206   6  36   0  78  49

我需要通过 igraph 找到一个函数，它可以给我以下格式的三角形：

COL1         COL2        COL3
node_a       node_b      node_c
node_a       node_b      node_d
node_a       node_b      node_e
node_f       node_g      node_h

任何帮助都会很棒，谢谢！

Answer 1

您可以使用 clique 函数（假设 g 是您的图表），

cl.tri=cliques(g,min=3,max=3)

通过

找到大小为三（三角形）的派系，然后 assemble 将它们放入数据框中

df<-lapply(cl.tri,function(x){V(g)$name[x]})

df2=data.frame(matrix(unlist(df),ncol=3,byrow=T))

使用标签提取 Igraph 中的所有三角形

Extract All Triangles in Igraph with Labels

r

igraph

triangle-count