使用 ggplot2 和 tablegrob 绘制分组箱线图,其中包含来自多个具有 NA 值的矩阵的汇总统计数据
Use ggplot2 and tablegrob to plot grouped boxplots with summary statistics from multiple matrices with NA values
我搜索了一段时间,但我仍然无法解决这个小问题,我想更改 tablegrob()
创建的 table 中数字的小数位。这样做会使整个视图看起来更好,如下所示:
这是代码:
a<-as.vector(matrixA) #matrices A-D contain randomly generated NA and
b<-as.vector(matrixB) #numerical values
c<-as.vector(matrixC)
d<-as.vector(matrixD)
data <- cbind(a, b, c, d)
plot <- melt(data)
colnames(plot)[2]<-"variable"
plot<-plot[,-1]
levels(df$variable) <- c("A", "B", "C",
"D")
xlabs <- paste(levels(plot$variable),"\n(N=",
colSums(!is.na(data)),")",sep="")
boxplot1<-ggplot(na.omit(plot),aes(x=variable,y=value,color=variable))+
geom_boxplot()+scale_x_discrete(labels=xlabs)+
xlab("X") + ylab("Y")+
ggtitle("Title")
#create inset table
multi.fun <- function(x) {
c(Mean = mean(x,na.rm=TRUE), Median = median(x,na.rm=TRUE),
IQR = IQR(x,na.rm=TRUE))}
sum.table<-data.frame(lapply(data.frame(a,b,c,d), multi.fun))
colnames(sum.table)<- c("A", "B", "C",
"D")
my_table <- tableGrob(sum.table, **digits=2**, gpar.coretext = gpar(fontsize=8),
gpar.coltext=gpar(fontsize=8), gpar.rowtext=gpar(fontsize=8))
#Create the viewports, push them, draw and go up
grid.newpage()
vp1 <- viewport(width = 0.75, height = 1, x = 0.375, y = .5)
subvp <- viewport(width = 0.3, height = 0.3, x = 0.75, y = 0.20)
print(boxplot1, vp = vp1)
upViewport(0)
pushViewport(subvp)
grid.draw(my_table)
我尝试在 tablegrob
中使用 digits
调整值,但没有用。我还尝试了 options(digits=2),但也没有用。有什么想法或想法吗?
colnames(sum.table)<- c("A", "B", "C","D")
***sum.table<-format(sum.table[1:3,1:4], digits=2)***
my_table <- tableGrob(sum.table,
gpar.coretext = gpar(fontsize=8), gpar.coltext=gpar(fontsize=8),
gpar.rowtext=gpar(fontsize=8))
在使用 tableGrob 之前格式化 data.frame
sum.table<-format(sum.table[1:3,1:4], digits=2)
,我得到了想要的结果:
我搜索了一段时间,但我仍然无法解决这个小问题,我想更改 tablegrob()
创建的 table 中数字的小数位。这样做会使整个视图看起来更好,如下所示:
这是代码:
a<-as.vector(matrixA) #matrices A-D contain randomly generated NA and
b<-as.vector(matrixB) #numerical values
c<-as.vector(matrixC)
d<-as.vector(matrixD)
data <- cbind(a, b, c, d)
plot <- melt(data)
colnames(plot)[2]<-"variable"
plot<-plot[,-1]
levels(df$variable) <- c("A", "B", "C",
"D")
xlabs <- paste(levels(plot$variable),"\n(N=",
colSums(!is.na(data)),")",sep="")
boxplot1<-ggplot(na.omit(plot),aes(x=variable,y=value,color=variable))+
geom_boxplot()+scale_x_discrete(labels=xlabs)+
xlab("X") + ylab("Y")+
ggtitle("Title")
#create inset table
multi.fun <- function(x) {
c(Mean = mean(x,na.rm=TRUE), Median = median(x,na.rm=TRUE),
IQR = IQR(x,na.rm=TRUE))}
sum.table<-data.frame(lapply(data.frame(a,b,c,d), multi.fun))
colnames(sum.table)<- c("A", "B", "C",
"D")
my_table <- tableGrob(sum.table, **digits=2**, gpar.coretext = gpar(fontsize=8),
gpar.coltext=gpar(fontsize=8), gpar.rowtext=gpar(fontsize=8))
#Create the viewports, push them, draw and go up
grid.newpage()
vp1 <- viewport(width = 0.75, height = 1, x = 0.375, y = .5)
subvp <- viewport(width = 0.3, height = 0.3, x = 0.75, y = 0.20)
print(boxplot1, vp = vp1)
upViewport(0)
pushViewport(subvp)
grid.draw(my_table)
我尝试在 tablegrob
中使用 digits
调整值,但没有用。我还尝试了 options(digits=2),但也没有用。有什么想法或想法吗?
colnames(sum.table)<- c("A", "B", "C","D")
***sum.table<-format(sum.table[1:3,1:4], digits=2)***
my_table <- tableGrob(sum.table,
gpar.coretext = gpar(fontsize=8), gpar.coltext=gpar(fontsize=8),
gpar.rowtext=gpar(fontsize=8))
在使用 tableGrob 之前格式化 data.frame
sum.table<-format(sum.table[1:3,1:4], digits=2)
,我得到了想要的结果: