Pandas HDFStore 奇怪的行为

Question

我对此很困惑，我有两个脚本运行ning 来自同一个笔记本服务器。我在同一个文件夹中有一个 HDFStore，但是对于一个脚本，它看起来是空的，而对于另一个则不是。这是两个笔记本中的相同代码运行：

import os 
os.getcwd()

Return 注意事项 1：'E:\DoingDataScience\Identify\Scripts'

Return 注意 2：'E:\DoingDataScience\Identify\Scripts'

store = pd.HDFStore('data_test.h5')
store.items

Return 注意事项 1：

<bound method HDFStore.items of <class 'pandas.io.pytables.HDFStore'>
File path: data_test.h5
/test_database            frame        (shape->[3,5])>

Return 注意 2:

<bound method HDFStore.items of <class 'pandas.io.pytables.HDFStore'>
File path: data_test.h5
Empty>

所有情况看起来都一样。它是否跟踪 Pandas DF 的来源？我认为这可能是由于 NB 1 创建了该文件，因此该文件已被 NB 1 打开。然而杀死 NB 1 并重新启动 NB 2 也没有做任何事情。

编辑：添加了os.stats：

注意事项 1 和注意事项 2：

nt.stat_result(st_mode=33206, st_ino=0L, st_dev=0L, st_nlink=0, 
st_uid=0, st_gid=0, st_size=1311400L, st_atime=1465072325L, 
st_mtime=1465149771L, st_ctime=1465072325L)

更新：重新启动后出现新错误：

HDF5ExtError：HDF5 错误回溯

文件 "C:\aroot\work\hdf5-1.8.15-patch1\src\H5F.c"，第 604 行，在 H5Fopen 中无法打开文件文件 "C:\aroot\work\hdf5-1.8.15-patch1\src\H5Fint.c"，第 1085 行，在 H5F_open 中无法读取超级块文件 "C:\aroot\work\hdf5-1.8.15-patch1\src\H5Fsuper.c"，第 294 行，在 H5F_super_read 中无法加载超级块文件 "C:\aroot\work\hdf5-1.8.15-patch1\src\H5AC.c"，第 1320 行，在 H5AC_protect 中 H5C_protect() 失败。文件 "C:\aroot\work\hdf5-1.8.15-patch1\src\H5C.c"，第 3574 行，在 H5C_protect 中无法加载条目文件 "C:\aroot\work\hdf5-1.8.15-patch1\src\H5C.c"，第 7954 行，在 H5C_load_entry 中无法加载条目文件 "C:\aroot\work\hdf5-1.8.15-patch1\src\H5Fsuper_cache.c"，第 476 行，在 H5F_sblock_load 中 t运行分类文件：eof = 800，sblock->base_addr = 0，stored_eoa = 1181448

HDF5 错误回溯结束

无法 open/create 文件 'data_test.h5'

Answer 1

很可能你已经写了你的数据

/test_database            frame        (shape->[3,5])>

在 NB1 的会话中并且没有关闭 store（这将保存并刷新您对 file/disk 的更改）

所以当您在 NB2 中打开 h5 文件时，它还没有刷新，因此是空的。

Pandas HDFStore 奇怪的行为

Pandas HDFStore weird behaviour

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