如何在 varImpPlot 上设置 x 限制

Question

如何更改 varImpPlot 从 randomForest 包生成的绘图的 x 限制？

如果我尝试

set.seed(4543)
data(mtcars)
mtcars.rf <- randomForest(mpg ~ ., data=mtcars, ntree=1000, keep.forest=FALSE,
                      importance=TRUE)
varImpPlot(mtcars.rf, scale=FALSE, type=1, xlim=c(0,15))

我收到以下错误：

Error in dotchart(imp[ord, i], xlab = colnames(imp)[i], ylab = "", main = if (nmeas == : formal argument "xlim" matched by multiple actual arguments".

这是因为 varImpPlot 定义了它自己的 x 限制，我想，但是如果我想自己设置 x 限制（可能是为了跨地块的一致性），我该如何解决这个问题？

Answer 1

首先，我使用 importance() 提取了值（感谢@dww 的建议）

impToPlot <- importance(mtcars.rf, scale=FALSE)

然后我使用 dotchart() 绘制它们，这允许我手动设置 x 限制（以及我想要的任何其他绘图功能）

dotchart(sort(impToPlot[,1]), xlim=c(0,15), xlab="%IncMSE")

如何在 varImpPlot 上设置 x 限制

How to set x limits on varImpPlot

plot

r

random-forest