无法安装h5py

Question

我正在尝试安装 h5py，但是当我执行 pip install h5py 或使用源代码中的 python setup.py install 时，出现致命错误：

hdf5.h: No such file or directory.

其他帖子提到做 pip install libhdf5-dev 或 pip install libhdf5-serial-dev 来解决这个问题，但它说 "no matching distribution found."

如何安装h5py？我使用 Linux 的 CentOS 6.5 版本通过 ssh 连接到 Odyssey 计算机。另外，我没有 sudo 权限。谢谢！

Answer 1

你的错误是因为你缺少hdf5.h header, pip不会安装开发headers，你需要使用你的包管理器安装它们，在 Centos 上它将是：

yum install hdf5-devel

如果您查看安装说明：

Source installation on Linux and OS X

您需要通过 apt-get、yum 或 Homebrew：

Python 2.6, 2.7, 3.3, or 3.4 with development headers (python-dev or similar)

HDF5 1.8.4 或更高版本，开发中的共享库版本 headers（libhdf5-dev 或类似版本）

NumPy 1.6.1 或更高版本

Answer 2

这 link 帮助了： https://github.com/Homebrew/legacy-homebrew/issues/23144

我安装了 LinuxHomeBrew 并做了：

brew tap homebrew/science
brew install hdf5
pip install h5py

我能够安装 h5py！

Answer 3

sudo apt-get update

sudo apt-get install python-h5py

(Source)

Answer 4

此外，不是 pip install libhdf5-dev 或 pip install libhdf5-serial-dev，而是 apt install libhdf5-dev 和 apt install libhdf5-serial-dev。那么，运行pip install h5py

Answer 5

运行下面解决了我的问题，因为我有一个与 xlocale.h

无法安装h5py

Cannot install h5py

python

packages

pip

h5py