日历热图：颜色不符合规定

Question

我正在使用 agstudy 修改的日历热图 (discussion and source GitHub)

总的来说，代码工作得很好，但我在让我的颜色代码工作时遇到了问题。

在所示示例中，前 3 周应为红色，第 4 周应为蓝色。这个序列总共应该重复 6 次，即应该有 6 周为蓝色（每 4 周）。

为了实现我的颜色代码，我从文件中加载十六进制代码的颜色列表并将其命名为 'user':

col.sty <- switch(color,
'user'=data_2$colorMicro,
'r2b'=c("#0571B0", "#92C5DE", "#F7F7F7", "#F4A582", "#CA0020"), #red to blue                                                                               
'r2g'=c("#D61818", "#FFAE63", "#FFFFBD", "#B5E384")  , #red to green
'w2b'=c("#045A8D", "#2B8CBE", "#74A9CF", "#BDC9E1", "#F1EEF6"),   #white to blue
'b2w'=grey.colors(5) )## black to white
# assign("col.sty", get(color))
calendar.pal <- colorRampPalette((col.sty), space = "rgb")

data_2的内容是：

colorMicro
#CC0000
#CC0000
#CC0000
#00CCFF
#CC0000
#CC0000
#CC0000
#00CCFF
#CC0000
#CC0000
#CC0000
#00CCFF
#CC0000
#CC0000
#CC0000
#00CCFF
#CC0000
#CC0000
#CC0000
#00CCFF
#CC0000
#CC0000
#CC0000
#00CCFF

这些是我想在热图中表示的 24 周的 24 个颜色值。变量 ncolors 设置为 24 并且 cuts 设置为 ncolors-1.

与 agstudy 的代码相比，我稍微更改了水平图设置。

# major plot ------------------------------------------------------------------
 p <- levelplot(value~woty*dotw | yr, data=dat, border = "black",
            layout = c(1, nyr%%7),
            col.regions = calendar.pal(ncolors),
            aspect='iso',
            between = list(x=0, y=c(1,1)),
            strip=TRUE,
            main =varname, 
            panel = function(x,y,z,...) {
              panel.levelplot(x,y,z,...)
              ll <- list(...)
              at = pretty(dat$pvalue)
              ind.pch <- cut(dat$pvalue, at, include.lowest = TRUE, labels = FALSE)
              pch.symbols <- pch.symbol[ind.pch]
              subscripts <- ll$subscripts
              x <- x[subscripts]
              y <- y[subscripts]
              pch.symbols <-  pch.symbols[subscripts]
              a=ifelse(dat$pvalue==0,15,ifelse(dat$pvalue==1,16,ifelse(dat$pvalue==2,17,ifelse(dat$pvalue==3,18,ifelse(dat$pvalue==4,25,ifelse(dat$pvalue==5,10,ifelse(dat$pvalue==6,65,ifelse(dat$pvalue==7,66,ifelse(dat$pvalue==67,S,NA)))))))))
              b=ifelse(dat$pvalue==0,"blue1",ifelse(dat$pvalue==1,"darkorange4",ifelse(dat$pvalue==2,"red",ifelse(dat$pvalue==3,"seashell4",ifelse(dat$pvalue==4,"magenta",ifelse(dat$pvalue==5,"limegreen",ifelse(dat$pvalue>5,'yellow','black')))))))
              panel.xyplot(x, y,fill =col.symbol ,col.symbol =b,
                           pch = a, cex=cex.symbol,
                           ,  ...)
              calendar.division(...)  
            },
            scales= scales,
            cuts = ncolors-1,
            colorkey= list(at=seq(from=1, to=24, by=1), col = calendar.pal(ncolors), width = 0.6, height = 0.5),
            xlim =extendrange(dat$woty,f=0.01),
            xlab="",ylab="",
            ylim=extendrange(dat$dotw,f=0.1),
            subscripts=TRUE,
            par.settings = calendar.theme)
  p
}

我无法找出为什么颜色会偏移并且与预期的颜色代码不匹配。有谁知道可能是什么原因？

Answer 1

终于，我发现了它是如何工作的：

在我的第一次尝试中，我按从 1 到 24 的升序为每周的几天分配了一个单独的数字。即第一周的天数设置为 1，第二周的天数设置为 2，依此类推。列表 colorMicro 包含 24 种颜色，这些颜色应该与各个星期相对应。该列表多次包含颜色。

在我的第二次尝试中，我为所有的日子分配了相同的颜色和相同的数字。同时我把相应的颜色放在列表colorMicro中。这样，每种颜色在列表中只出现一次，并且与日历中的数字出现的顺序相同。变量 ncolors 我设置为一个很大的数字，现在一切正常。 Example

考虑到 R 之外的数据生成，第一种方法对我来说更容易，但由于某种原因它不起作用。知道这个事实后，第二种方法也很容易，并且会导致正确的绘图行为。现在可以随意为每一天或每一周分配预定义的颜色，这正是我所需要的。也许这对其他人也有用。

日历热图：颜色不符合规定

Calendar Heatmap: Colors not as specified

r

heatmap

levelplot