使用外部 C 库在 Rcpp 中编译 C++

Question

我正在尝试使用使用外部库的 Rcpp 代码构建 R 包。我之前曾问过关于如何在包中使用外部 C 库的问题。我面临的问题是一旦包含以下代码行

y = N_VNew_Serial(3);

我遇到错误

sundials_test.o:sundials_test.cpp:(.text+0x2ba): undefined reference to `N_VNew_Serial'
collect2: ld returned 1 exit status
Error in Rcpp::sourceCpp("src/sundials_test.cpp") : 
  Error occurred building shared library

我没有收到行的错误

N_Vector y = NULL;

所以，我认为与图书馆的连接工作正常。我还确认 N_VNewSerial() 的函数声明在 nvector/nvector_serial.h 如果您需要查看整个包代码，它可用 here

特定 Rcpp 文件的代码粘贴在下方

#include <Rcpp.h>

// #include <iostream.h>
#include <cvode/cvode.h>               /* prototypes for CVODE fcts., consts. */
#include <nvector/nvector_serial.h>    /* serial N_Vector types, fcts., macros */
#include <cvode/cvode_dense.h>         /* prototype for CVDense */
#include <sundials/sundials_dense.h>   /* definitions DlsMat DENSE_ELEM */
#include <sundials/sundials_types.h>   /* definition of type realtype */

using namespace Rcpp;

void InitialConditions (NumericVector x){

  N_Vector y = NULL;
  // y = N_VNew_Serial(3);
  //
  // NV_Ith_S(y,0) = 1;
  // NV_Ith_S(y,1) = 2;
  // NV_Ith_S(y,2) = 3;


}

我不确定为什么代码向同一个头文件中的一个函数报告 undefined reference 但不向另一个函数报告，非常感谢任何有助于理解解决此错误的帮助。

谢谢！

SN248

Answer 1

这是一个 link 错误，而不是编译错误。编译成功让您进入 link 步骤。但是

sundials_test.o:sundials_test.cpp:(.text+0x2ba): \
  undefined reference to `N_VNew_Serial'
collect2: ld returned 1 exit status
Error in Rcpp::sourceCpp("src/sundials_test.cpp") : 
  Error occurred building shared library

非常清楚：R 无法构建共享库，因为您没有 link 提供它的目标代码（我想是来自日晷）。

使用外部 C 库在 Rcpp 中编译 C++

Compiling C++ in Rcpp with external C library

c++

r

rcpp

r-package

sundials