如何拆分和合并错误分割的区域
How to Split and Merge Erroneously Segmented Regions
我对一张细胞簇的图片进行了分水岭分割。似乎有许多细胞簇没有被充分分割或根本没有分割。也有被过度分割的单细胞。我可以用什么方法来合并分割过度的单个细胞，进一步分割分割不足的细胞簇？
编辑：通过确定单元格的面积是否在正常大小的单元格的某个平均范围内来确定单元格是否被过度分割或分割不足的标准。我不确定这是否是个好主意。任何帮助将不胜感激，谢谢。
您必须决定什么是您理想或预期的细胞；显然它是一些没有曲率反转的圆形（即它没有方向反转）=简单形状。为此，您可以使用圆度等形状特征：您需要确定您接受的圆度范围是多少。
对于分水岭，我认为进行过度分割可能更好 - 然后可以根据组合形状是否满足标准（如上所述）合并附近的形状。可以使用其他形状特征（伸长率等）。
如果您进行欠分割，您别无选择（根据您使用的方法），只能对剩余的形状重复分割。
你不能指望做到零错误，分割一切完美。也许你有更小或更大的细胞。可能你画质真的很差
如果您知道单元格的面积在某个范围内，只需调整分水岭参数（阈值），直到平均估计面积与您的先验知识一致。
如果您有非常大的细分（大面积，超过平均面积的两倍左右）让分水岭 运行 在本地再次使用更高的阈值。
如果您在当地有非常小的段，让分水岭 运行 在当地再次使用较小的阈值。
我不会做更多，除非使用另一种算法，例如 ilastik，它具有半自动分割。
我对一张细胞簇的图片进行了分水岭分割。似乎有许多细胞簇没有被充分分割或根本没有分割。也有被过度分割的单细胞。我可以用什么方法来合并分割过度的单个细胞，进一步分割分割不足的细胞簇？
编辑：通过确定单元格的面积是否在正常大小的单元格的某个平均范围内来确定单元格是否被过度分割或分割不足的标准。我不确定这是否是个好主意。任何帮助将不胜感激，谢谢。
您必须决定什么是您理想或预期的细胞；显然它是一些没有曲率反转的圆形（即它没有方向反转）=简单形状。为此，您可以使用圆度等形状特征：您需要确定您接受的圆度范围是多少。
对于分水岭，我认为进行过度分割可能更好 - 然后可以根据组合形状是否满足标准（如上所述）合并附近的形状。可以使用其他形状特征（伸长率等）。
如果您进行欠分割，您别无选择（根据您使用的方法），只能对剩余的形状重复分割。
你不能指望做到零错误，分割一切完美。也许你有更小或更大的细胞。可能你画质真的很差
如果您知道单元格的面积在某个范围内，只需调整分水岭参数（阈值），直到平均估计面积与您的先验知识一致。
如果您有非常大的细分（大面积，超过平均面积的两倍左右）让分水岭 运行 在本地再次使用更高的阈值。
如果您在当地有非常小的段，让分水岭 运行 在当地再次使用较小的阈值。
我不会做更多，除非使用另一种算法，例如 ilastik，它具有半自动分割。