如何比较头文件（fasta）的一部分并将其放入一个文件中？
how to compare a part of header file(fasta) and fit this to one file together?
我在一个目录中有更多 fasta 个文件，它们的开头相同但结尾不同：
file1abgff
-----------
file2adferr
------------
file3adfr
----------
file1adcef
-----------
如何比较目录中所有文件的开头并将匹配项放在一个新文件中 (example >file1abgffadcef)？
这段代码似乎可以解决您的问题。
假设您有输入文件：
cat input
>file1abgff
>file2adferr
>file3adfr
>file1adcef
这是我的解决方案：
sed 's/[0-9]/& /' input | awk '{a[]=( in a ? a[]"|" : [=11=])}END{for (i in a){print a[i]}}' | sed 's/ //' | grep "|" | sed 's/|//'
>file1abgffadcef
我在一个目录中有更多 fasta 个文件，它们的开头相同但结尾不同：
file1abgff
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file2adferr
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file3adfr
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file1adcef
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如何比较目录中所有文件的开头并将匹配项放在一个新文件中 (example >file1abgffadcef)？
这段代码似乎可以解决您的问题。
假设您有输入文件：
cat input
>file1abgff
>file2adferr
>file3adfr
>file1adcef
这是我的解决方案：
sed 's/[0-9]/& /' input | awk '{a[]=( in a ? a[]"|" : [=11=])}END{for (i in a){print a[i]}}' | sed 's/ //' | grep "|" | sed 's/|//'
>file1abgffadcef