加载 single-column CSV 作为 R 中的值

Question

我想知道如何将单列 CSV 文件（使用 header）转换为 R 中的字符列表。我已尝试在 RStudio 中将其加载为 data.frame然后使用 as.character 但软件给了我一个随机逗号分隔的字符串。

我的文件有将近 1000 行，我无法使用

手动输入它们

sample = c("97_278", "BR5-045", "10-409", ...)

我的文件看起来像这样（前 5 行）

Samples
97_278
BR5-045
10-409
BR8-316
97_420

这是我在值 table

下使用 as.character 得到的结果

sample_char     "c(235, 310, 103, ..."

这就是我要找的东西

sample_char     chr [1:1000] "97_278" "BR5-045" "10-409"

其中 sample_char 是新变量。

Answer 1

我觉得问题还是没有说清楚，你说的这个基本功能是可以实现的。如果我弄错了请纠正我。

> a <- read.csv("cor.csv",header = T,sep = ",",stringsAsFactors = F)
> a$Samples
[1] "97_278"  "BR5-045" "10-409"  "BR8-316" "97_420" 
> class(a$Samples)
[1] "character"

Answer 2

如果是单列，scan最好读成vector

res <- scan("cor.csv", sep="", what = "", quiet=TRUE)
str(res)
#chr [1:6] "Samples" "97_278" "BR5-045" "10-409" "BR8-316" ...

如果我们需要 list 个值，可以使用 as.list(res)。

Answer 3

我最终通过使用 as.matrix 和之后的基本字符列表函数 (c) 完成了它。所以它是这样的

 sample2 =as.matrix(sample)
 sample3 = c(sample2)

加载 single-column CSV 作为 R 中的值

Load single-column CSV as value in R

csv

r

chr

dataframe