是否可以在 R Jupyter 笔记本中安装 bioconductor 包 'rain'？
Is it possible to install bioconductor package 'rain' in R Jupyter notebook?
我想在 Jupyter notebook 中安装 bioconductor rain package for R。
我无法按照上面链接的网站上给出的说明在 Jupyter 笔记本中安装此包 - 在 R Jupiter 笔记本中：
source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("rain")
我收到以下错误：
Warning message:
In install.packages(pkgs = doing, lib = lib, ...): installation of package ‘gmp’ had non-zero exit statusWarning message:
In install.packages(pkgs = doing, lib = lib, ...): installation of package ‘rain’ had non-zero exit status
我能够在 Jupyter (DESeq2) 中安装不同的 bioconductor 包，在命令行中使用以下命令：
conda install bioconductor-deseq2
但是这种方法对雨包不起作用，因为与deseq2不同，雨不在anaconda云上。
是否可以在 Jupyter 中安装不在 anaconda 云上的 bioconductor 包（如 rain 包），如果可以，如何安装？
谢谢！
我找到了解决问题的方法。有两种安装 IRkernel 的方法：1) 使用 CRAN+Github（说明：http://irkernel.github.io/）和 2) 作为名为 r-irkernel 的 conda 包。我使用的后一种方法安装了 运行s conda 自己的 R 版本，就可以安装的包而言，它的功能更为有限。而 CRAN+Github 方法允许 Jupyter 使用您计算机上已安装的 R 版本及其可以 运行.
的任何软件包
我想在 Jupyter notebook 中安装 bioconductor rain package for R。
我无法按照上面链接的网站上给出的说明在 Jupyter 笔记本中安装此包 - 在 R Jupiter 笔记本中：
source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("rain")
我收到以下错误：
Warning message:
In install.packages(pkgs = doing, lib = lib, ...): installation of package ‘gmp’ had non-zero exit statusWarning message:
In install.packages(pkgs = doing, lib = lib, ...): installation of package ‘rain’ had non-zero exit status
我能够在 Jupyter (DESeq2) 中安装不同的 bioconductor 包，在命令行中使用以下命令：
conda install bioconductor-deseq2
但是这种方法对雨包不起作用，因为与deseq2不同，雨不在anaconda云上。
是否可以在 Jupyter 中安装不在 anaconda 云上的 bioconductor 包（如 rain 包），如果可以，如何安装？
谢谢！
我找到了解决问题的方法。有两种安装 IRkernel 的方法：1) 使用 CRAN+Github（说明：http://irkernel.github.io/）和 2) 作为名为 r-irkernel 的 conda 包。我使用的后一种方法安装了 运行s conda 自己的 R 版本，就可以安装的包而言，它的功能更为有限。而 CRAN+Github 方法允许 Jupyter 使用您计算机上已安装的 R 版本及其可以 运行.
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