如何在执行多维缩放后获得特征值？

Question

我有兴趣在执行多维缩放后查看特征值。什么功能可以做到这一点？我看了 documentation，但它根本没有提到特征值。

这是一个代码示例：

mds = manifold.MDS(n_components=100, max_iter=3000, eps=1e-9,
                   random_state=seed, dissimilarity="precomputed", n_jobs=1)
results = mds.fit(wordDissimilarityMatrix)
# need a way to get the Eigenvalues

Answer 1

我也没有通过阅读文档找到它。我怀疑他们不是在表演 classical MDS，而是在表演一些更复杂的东西：

“Modern Multidimensional Scaling - Theory and Applications” Borg, I.; Groenen P. Springer Series in Statistics (1997)

“Nonmetric multidimensional scaling: a numerical method” Kruskal, J. Psychometrika, 29 (1964)

“Multidimensional scaling by optimizing goodness of fit to a nonmetric hypothesis” Kruskal, J. Psychometrika, 29, (1964)

如果您正在寻找每个经典 MDS 的特征值，那么您自己得到它们并不难。步骤是：

获取距离矩阵。然后平方。
执行双重居中。
求特征值和特征向量
Select 前 k 个特征值。
你的第 i 个主成分是 sqrt(eigenvalue_i)*eigenvector_i

请参阅下面的代码示例：

import numpy.linalg as la
import pandas as pd

# get some distance matrix
df = pd.read_csv("http://rosetta.reltech.org/TC/v15/Mapping/data/dist-Aus.csv")
A = df.values.T[1:].astype(float)
# square it
A = A**2

# centering matrix
n = A.shape[0]
J_c = 1./n*(np.eye(n) - 1 + (n-1)*np.eye(n))

# perform double centering
B = -0.5*(J_c.dot(A)).dot(J_c)

# find eigenvalues and eigenvectors
eigen_val = la.eig(B)[0]
eigen_vec = la.eig(B)[1].T

# select top 2 dimensions (for example)
PC1 = np.sqrt(eigen_val[0])*eigen_vec[0]
PC2 = np.sqrt(eigen_val[1])*eigen_vec[1]

如何在执行多维缩放后获得特征值？

How to obtain the eigenvalues after performing Multidimensional scaling?

python

eigenvalue

multi-dimensional-scaling

dimensionality-reduction

scikit-learn