如何正确屏蔽 numpy 二维数组?

How to properly mask a numpy 2D array?

假设我有一个二维坐标数组,看起来像

x = array([[1,2],[2,3],[3,4]])

到目前为止,在我之前的工作中,我生成了一个最终看起来像

的掩码

mask = [False,False,True]

当我尝试在 2D 坐标向量上使用此蒙版时,出现错误

newX = np.ma.compressed(np.ma.masked_array(x,mask))

>>>numpy.ma.core.MaskError: Mask and data not compatible: data size 
   is 6, mask size is 3.`

我想这是有道理的。所以我尝试简单地使用以下掩码:

mask2 = np.column_stack((mask,mask))
newX = np.ma.compressed(np.ma.masked_array(x,mask2))

我得到的结果很接近:

>>>array([1,2,2,3])

我所期望(和想要)的:

>>>array([[1,2],[2,3]])

一定有更简单的方法吗?

这是您要找的吗?

import numpy as np
x[~np.array(mask)]
# array([[1, 2],
#        [2, 3]])

或来自numpy masked array

newX = np.ma.array(x, mask = np.column_stack((mask, mask)))
newX

# masked_array(data =
#  [[1 2]
#  [2 3]
#  [-- --]],
#              mask =
#  [[False False]
#  [False False]
#  [ True  True]],
#        fill_value = 999999)

在你的最后一个例子中,问题不在于面具。是你对compressed的使用。来自 compressed 的文档字符串:

Return all the non-masked data as a 1-D array.

因此 compressed 将未屏蔽的值展平为一维数组。 (必须的,因为不能保证压缩后的数据一定是n维结构。)

压缩前先看一下屏蔽数组:

In [8]: np.ma.masked_array(x, mask2)

Out[8]: 
masked_array(data =
 [[1 2]
 [2 3]
 [-- --]],
             mask =
 [[False False]
 [False False]
 [ True  True]],
       fill_value = 999999)

你的 x 是 3x2:

In [379]: x
Out[379]: 
array([[1, 2],
       [2, 3],
       [3, 4]])

制作一个 3 元素布尔掩码:

In [380]: rowmask=np.array([False,False,True])

可用于 select 为 True 或 False 的行。在这两种情况下,结果都是 2d:

In [381]: x[rowmask,:]
Out[381]: array([[3, 4]])

In [382]: x[~rowmask,:]
Out[382]: 
array([[1, 2],
       [2, 3]])

这没有使用 MaskedArray 子类。要制作这样的数组,我们需要一个形状匹配 x 的掩码。没有规定只屏蔽一维。

In [393]: xmask=np.stack((rowmask,rowmask),-1)  # column stack

In [394]: xmask
Out[394]: 
array([[False, False],
       [False, False],
       [ True,  True]], dtype=bool)

In [395]: np.ma.MaskedArray(x,xmask)
Out[395]: 
masked_array(data =
 [[1 2]
 [2 3]
 [-- --]],
             mask =
 [[False False]
 [False False]
 [ True  True]],
       fill_value = 999999)

compressed 应用到它会产生一个混乱的数组:array([1, 2, 2, 3])

由于屏蔽是逐个元素进行的,它可以屏蔽第 1 行中的一个元素、第 2 行中的 2 个元素等。因此通常 compressing,删除屏蔽的元素不会产生二维数组。扁平化形式是唯一的通用选择。

np.ma 当屏蔽值分散时最有意义。如果您想 select 或 deselect 整行或整列,它没有多大价值。

===============

以下是更典型的屏蔽数组:

In [403]: np.ma.masked_inside(x,2,3)
Out[403]: 
masked_array(data =
 [[1 --]
 [-- --]
 [-- 4]],
             mask =
 [[False  True]
 [ True  True]
 [ True False]],
       fill_value = 999999)

In [404]: np.ma.masked_equal(x,2)
Out[404]: 
masked_array(data =
 [[1 --]
 [-- 3]
 [3 4]],
             mask =
 [[False  True]
 [ True False]
 [False False]],
       fill_value = 2)

In [406]: np.ma.masked_outside(x,2,3)
Out[406]: 
masked_array(data =
 [[-- 2]
 [2 3]
 [3 --]],
             mask =
 [[ True False]
 [False False]
 [False  True]],
       fill_value = 999999)

因为 none 这些解决方案对我有用,所以我想写下解决方案的作用,也许对其他人有用。我使用 python 3.x 并处理了两个 3D 数组。我称之为 data_3D 的一个包含大脑扫描记录的浮点值,另一个 template_3D 包含代表大脑区域的整数。我想根据 template_3D:

data_3D 中选择对应于整数 region_code 的那些值
my_mask = np.in1d(template_3D, region_code).reshape(template_3D.shape)
data_3D_masked = data_3D[my_mask]

这给了我一个只有相关录音的一维数组。

有了np.where你可以做各种各样的事情:

x_maskd = np.where(mask, x, 0)

如果你有

A =  [[  8.   0. 165.  22. 164.  47. 184. 185.]
      [  0.   6. -74. -27.  63.  49. -46. -48.]
      [165. -74.   0.   0.   0.   0.   0.   0.]
      [ 22. -27.   0.   0.   0.   0.   0.   0.]
      [164.  63.   0.   0.   0.   0.   0.   0.]
      [ 47.  49.   0.   0.   0.   0.   0.   0.]
      [184. -46.   0.   0.   0.   0.   0.   0.]
      [185. -48.   0.   0.   0.   0.   0.   0.]]

你的面具是

mask = np.array([True, True, True, False, True, False, True, False])

那么你的蒙版 A 就变成了

A[mask, :][:, mask] = [[  8.   0. 165. 164. 184.]
                       [  0.   6. -74.  63. -46.]
                       [165. -74.   0.   0.   0.]
                       [164.  63.   0.   0.   0.]
                       [184. -46.   0.   0.   0.]]