使用 ggplot 绘制带有图例的图像

Question

我想使用 ggplot2 在医院平面图的 PNG 图像上绘制 OHS 事件。我试过以 ggimage 的形式阅读这张非地理地图。

到目前为止，我已尝试对我拥有的数据集 (14462) 进行以下观察。

示例数据集

toy <- data.frame(patient_ID = c(1001,1001,1002,1003,1004), 
               SEX = c("M","M","F","F","F"),
              phenotype = c("Psychiatric","Psychiatric", "Cardio",
                            "Cancer","Psychiatric"),
                            x = c(0.5737, 0.5737, 0.6968, 0.4704, 0.6838),
                            y= c(0.3484, 0.3484, 0.62, 0.5216, 0.2486))

我试过以光栅形式读取文件，然后使用 ggmaps，但难度不小。

library(ggmap)
library(png)
library(ggplot2)
library(data.table)

toy <- fread("toy.csv")

# read in image 

r <- readPNG("ICU-crop.png")

#use ggimage to convert to plot and add gender
ggimage(r, scale_axes = TRUE) +
  geom_point(aes(x = x, y = y, colour = SEX), data = toy,
             size = I(1), fill = NA)

我真的很想使用 ggplot 但需要图例。我不确定我可以使用哪些其他方法在 PNG 上绘制 ggplot。

Answer 1

真正的 "magic" 只是调用 ggimage() 中的 fullpage=FALSE，但是你必须清理一下坐标轴：

ggimage(r, fullpage = FALSE, scale_axes = TRUE) +
 geom_point(aes(x = x, y = y, colour = SEX), 
            data = toy, size = I(1), fill = NA) +
  labs(x=NULL, y=NULL) +
  theme(axis.text=element_blank()) +
  theme(axis.ticks=element_blank())

您也应该清理图例，我建议稍微调亮基本图像，因为很难看到它与您要叠加的颜色之间的对比（除非它们是大对象）。

使用 ggplot 绘制带有图例的图像

Use ggplot to plot over an image with legend

r

raster

ggplot2

ggmap

ggimage