Pytable 检查列是否存在

Question

是否可以使用Pytables（或Pandas）检测hdf文件的table是否包含某列？要加载我使用的 hdf 文件：

from pandas.io.pytables import HDFStore
# this doesn't read the full file which is good
hdf_store = HDFStore('data.h5', mode='r')
# returns a "Group" object, not sure if this could be used...
hdf_store.get_node('tablename')

我也可以直接使用 Pytables 而不是 Pandas。目的是不加载 hdf 文件的所有数据，因为这些文件可能很大，我只想确定某个列是否存在。

Answer 1

我可能找到了解决方案，但不确定 (1) 它为何有效以及 (2) 这是否是一个可靠的解决方案。

import tables
h5 = tables.openFile('data.h5', mode='r')
df_node = h5.root.__getattr__('tablename')
# Not sure why `axis0` contains the column data, but it seems consistent
# with the tested h5 files.
columns = df_node.axis0[:]

columns 包含一个包含所有列名称的 numpy 数组。

Answer 2

接受的解决方案不适用于 Pandas 0.20.3 和 PyTables 3.3.0（HDF 文件是使用 Pandas 创建的）。但是，这有效：

pd.HDFStore('data.hd5', mode='r').get_node('/path/to/pandas/df').table.colnames

Pytable 检查列是否存在

Pytables check if column exists

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