导入 GeoTiff 文件时出错 - R RASTER 包

Question

我正在尝试创建一个循环，以使用栅格{raster} 自动上传一些 GEOTiff 数据集。首先，我使用变量 path 定义了保存所有文件的文件夹。然后我创建了一个循环，如下面的代码所示，其中 crop_name 是一个向量，其中包含我要导入的 GEOTiff 数据集名称的可变部分。

这是我正在使用的代码：

path <- file.path("C:","Users","pbarbieri","Documents","Pietro","R Analysis", "Budgets test countries baseline scenario", "global", "crop prodution", "All")

for (i in 1:length(crop_name)){

  name_file_upload <-paste(crop_name[i],"_Production.tif",sep = "")
  path_2 <- file.path(path, name_file_upload)
  name_file <- paste(crop_name[i], "production", sep = "_")
  assign(name_file,  raster(path_2))   
}

当我运行代码时，我收到以下错误消息：

Error in .local(.Object, ...) : 
   `C:\Users\pbarbieri\Documents\Pietro\R Analysis\Budgets test countries baseline scenario\global\crop prodution\All\barley_Production.tif' does not exist in the file system,
   and is not recognised as a supported dataset name.

Error in .rasterObjectFromFile(x, band = band, objecttype = "RasterLayer",  : 
Cannot create a RasterLayer object from this file. (file does not exist)

然而，如果我尝试使用与 path_2 中生成和保存的文件相同的路径手动导入其中一个 GEOTiff 文件，我不会收到任何错误。我读到有时 {raster} 包可能会给数据集名称中的下划线带来问题，但删除下划线并没有解决我的问题。我做错了什么？

Answer 1

使用 assign 是个坏主意。相反，使用列表并执行类似

的操作

x <- list()
for () {
    x[[i]] <- raster(path_2)
}

但您可能想要的是：

path <- file.path("C:/Users/pbarbieri/Documents/Pietro/R Analysis/Budgets test countries baseline scenario/global/crop prodution/All", 
     paste0(crop_name,"_Production.tif"))
s <- stack(x)

没有理由认为下划线很重要。

Answer 2

这应该可以解决您的问题：

   dir <- "Path to files"
   files <- list.files(path = dir, pattern = ".tif")
   rasters <- lapply(paste0(dir, files), raster)

您可以在这里使用栅格列表做很多事情，例如 stack、lapply 其他功能，或者使用 for 循环为它们分配自己的个人名字。

导入 GeoTiff 文件时出错 - R RASTER 包

Error in importing GeoTiff files - R RASTER package

error-handling

r

geotiff

r-raster